23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0221 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0221  plasma membrane H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  100 
 
 
845 aa  1719    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.927678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1245  hypothetical protein  33.33 
 
 
820 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.162309999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.79 
 
 
1344 aa  365  3e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2859  hypothetical protein  33.94 
 
 
866 aa  350  8e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8550  hypothetical protein  34.86 
 
 
728 aa  348  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4431  hypothetical protein  34.48 
 
 
954 aa  347  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28820  hypothetical protein  34.52 
 
 
832 aa  343  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778693  decreased coverage  0.00000000161145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5143  hypothetical protein  35.92 
 
 
798 aa  334  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.09812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3424  hypothetical protein  33.07 
 
 
828 aa  332  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.827282  normal  0.753977 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0139  hypothetical protein  31.34 
 
 
812 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2000  hypothetical protein  32.63 
 
 
797 aa  299  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  30.68 
 
 
1123 aa  289  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2541  hypothetical protein  29.96 
 
 
750 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1169  hypothetical protein  29.56 
 
 
782 aa  274  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5416  hypothetical protein  30.42 
 
 
747 aa  266  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1947  hypothetical protein  25.93 
 
 
777 aa  204  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231119  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1836  hypothetical protein  25.93 
 
 
798 aa  203  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2290  hypothetical protein  25.93 
 
 
798 aa  201  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.947469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4154  hypothetical protein  31.48 
 
 
643 aa  188  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1078  hypothetical protein  29.19 
 
 
735 aa  183  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495245  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0328  hypothetical protein  25.84 
 
 
726 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2561  hypothetical protein  27.02 
 
 
867 aa  131  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00089878  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0063  hypothetical protein  31.17 
 
 
1356 aa  103  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.80787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>