23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_28820 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2859  hypothetical protein  55.41 
 
 		 866 aa  870    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4431  hypothetical protein  66.11 
 
 		 954 aa  939    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3424  hypothetical protein  80.36 
 
 		 828 aa  1313    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.827282  normal  0.753977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28820  hypothetical protein  100 
 
 		 832 aa  1691    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778693  decreased coverage  0.00000000161145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5143  hypothetical protein  47.2 
 
 		 798 aa  581  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0139  hypothetical protein  41.38 
 
 		 812 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1836  hypothetical protein  38.34 
 
 		 798 aa  521  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2290  hypothetical protein  38.46 
 
 		 798 aa  519  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.947469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1947  hypothetical protein  38.44 
 
 		 777 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231119  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1169  hypothetical protein  38.25 
 
 		 782 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1245  hypothetical protein  36.44 
 
 		 820 aa  480  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.162309999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.48 
 
 		 1344 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0221  plasma membrane H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  34.57 
 
 		 845 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.927678  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2000  hypothetical protein  33.1 
 
 		 797 aa  317  8e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  33.38 
 
 		 1123 aa  312  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2541  hypothetical protein  31.06 
 
 		 750 aa  308  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5416  hypothetical protein  31.29 
 
 		 747 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8550  hypothetical protein  30.79 
 
 		 728 aa  253  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128819  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0328  hypothetical protein  30.38 
 
 		 726 aa  250  9e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4154  hypothetical protein  34.01 
 
 		 643 aa  238  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1078  hypothetical protein  28.87 
 
 		 735 aa  177  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2561  hypothetical protein  30.94 
 
 		 867 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00089878  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0063  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.80787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>