51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3409 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  98.13 
 
 		 831 bp  1080    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3409    100 
 
 		 2156 bp  4274    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.56 
 
 		 798 bp  293  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.71 
 
 		 831 bp  293  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.21 
 
 		 795 bp  250  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.72 
 
 		 795 bp  232  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3876  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85.45 
 
 		 795 bp  222  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.16 
 
 		 795 bp  220  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.79 
 
 		 792 bp  204  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16730  glucose/ribitol dehydrogenase family protein  83.46 
 
 		 789 bp  159  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.681173  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03629  oxidoreductase  82.96 
 
 		 777 bp  155  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  88.54 
 
 		 780 bp  103  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736401  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.78 
 
 		 780 bp  101  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2186  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  79.77 
 
 		 792 bp  99.6  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.21 
 
 		 777 bp  93.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.298877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.21 
 
 		 780 bp  77.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.861645  normal  0.226141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3053  oxidoreductase  83.05 
 
 		 783 bp  75.8  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.42458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.16 
 
 		 783 bp  73.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2540  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  78.84 
 
 		 777 bp  73.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.62 
 
 		 783 bp  71.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.75 
 
 		 789 bp  67.9  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.80685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.46 
 
 		 783 bp  67.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.73 
 
 		 792 bp  67.9  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.46 
 
 		 837 bp  67.9  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1983  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.73 
 
 		 792 bp  67.9  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.42 
 
 		 777 bp  65.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.567568 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  93.18 
 
 		 780 bp  63.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.15 
 
 		 780 bp  60  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154867  normal  0.0871554 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5619  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.86 
 
 		 834 bp  60  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0753007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.29 
 
 		 783 bp  56  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  94.29 
 
 		 780 bp  54  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.930185  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.11 
 
 		 747 bp  52  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0734499  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0838    84.29 
 
 		 3315 bp  52  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00135022  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  90.48 
 
 		 807 bp  52  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1882  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  87.04 
 
 		 780 bp  52  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1388  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  87.04 
 
 		 780 bp  52  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1210  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  79.85 
 
 		 783 bp  52  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.475284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  87.04 
 
 		 780 bp  52  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0730868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1243  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  87.04 
 
 		 780 bp  52  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00809972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1234  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  87.04 
 
 		 780 bp  52  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.48 
 
 		 780 bp  52  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.400056 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0789  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  87.04 
 
 		 780 bp  52  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0355352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1078  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  87.04 
 
 		 780 bp  52  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.296983  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.24 
 
 		 795 bp  50.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0866404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2538  Short-chain dehydrogenase/reductase  90.24 
 
 		 780 bp  50.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3257  putative 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  90.24 
 
 		 780 bp  50.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.95 
 
 		 780 bp  50.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2311  hypothetical protein  96.55 
 
 		 282 bp  50.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.128233  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.02 
 
 		 783 bp  50.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.285403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 801 bp  50.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.228735 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.95 
 
 		 780 bp  50.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336154  normal  0.942948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>