More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1252 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1252  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
319 aa  610  9.999999999999999e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.322292  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0583  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46 
 
 
322 aa  212  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401485  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.43 
 
 
329 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.08 
 
 
349 aa  210  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  40.76 
 
 
349 aa  205  7e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2708  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.32 
 
 
327 aa  205  7e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00108828  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.87 
 
 
312 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000544385  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.03 
 
 
327 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0320  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.13 
 
 
349 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000221131  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0733  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.45 
 
 
323 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0144586  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1572  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.56 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0772  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.64 
 
 
331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11947  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2626  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.26 
 
 
306 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.738919  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2474  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.68 
 
 
333 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.508671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.64 
 
 
331 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.98 
 
 
331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1002  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.67 
 
 
329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.35272 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.9 
 
 
313 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.9 
 
 
339 aa  198  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.42 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.25 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0963  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.48 
 
 
361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0178075 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.97 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2614  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.44 
 
 
320 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.624613  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1034  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.67 
 
 
325 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0163  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.27 
 
 
299 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0366877 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.07 
 
 
299 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417254  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.07 
 
 
299 aa  193  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.46 
 
 
334 aa  193  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13680  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.22 
 
 
331 aa  192  7e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.381584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2663  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.31 
 
 
336 aa  192  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1991  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.16 
 
 
307 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105239  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3196  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.95 
 
 
305 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.421638  decreased coverage  0.00000374346 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0205  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.16 
 
 
307 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0678  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.77 
 
 
313 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1105  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.59 
 
 
327 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4816  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.8 
 
 
283 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1653  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.85 
 
 
316 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.489649 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01891  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.56 
 
 
305 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08780  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.22 
 
 
318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000136527 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2210  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  43.23 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0172475  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0559  methyltransferase  39.48 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000972435  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5106  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.35 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.41 
 
 
391 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00627417  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0047  methyltransferase  41.05 
 
 
328 aa  189  5e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.509185  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1444  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.28 
 
 
324 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0770792  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.31 
 
 
353 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2418  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.85 
 
 
333 aa  188  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0532516 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0975  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.41 
 
 
296 aa  188  8e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000346551  normal  0.234872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1046  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.13 
 
 
311 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.96 
 
 
313 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03266  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.38 
 
 
313 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00192279  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1562  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.48 
 
 
332 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24970  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.44 
 
 
327 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.886239 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.31 
 
 
319 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0302613  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0650  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.72 
 
 
520 aa  186  4e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0738  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.27 
 
 
332 aa  186  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0462605  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.2 
 
 
337 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0173  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.26 
 
 
359 aa  185  8e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.61 
 
 
398 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2795  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.91 
 
 
312 aa  185  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000553872  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1539  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.69 
 
 
304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.74 
 
 
332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.97 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3270  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.44 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000287987  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.54 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.1 
 
 
312 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3275  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.26 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12195  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.16 
 
 
396 aa  182  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0705243  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf262  S-adenosyl-methyltransferase  36.65 
 
 
286 aa  181  1e-44  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2934  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.67 
 
 
337 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00284592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2869  methyltransferase  44.98 
 
 
315 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1222  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.77 
 
 
310 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4019  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.77 
 
 
310 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.219657  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.35 
 
 
304 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2111  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.05 
 
 
294 aa  180  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.424898  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3763  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.54 
 
 
310 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01891  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.18 
 
 
300 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0111  methyltransferase  43.17 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.23 
 
 
353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0888  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.09 
 
 
357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127807  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0787  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.6 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3463  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.57 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2568  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.1 
 
 
310 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.53 
 
 
318 aa  179  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.00489448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.48 
 
 
303 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.26 
 
 
345 aa  180  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01911  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.17 
 
 
300 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02461  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.89 
 
 
304 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27231  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.27 
 
 
310 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40 
 
 
312 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3531  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.07 
 
 
378 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0334223  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.45 
 
 
310 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0745363 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3677  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.45 
 
 
310 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.77 
 
 
310 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000219611  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4057  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.45 
 
 
310 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1727  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.88 
 
 
291 aa  178  9e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3819  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.56 
 
 
310 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3964  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.45 
 
 
310 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.01 
 
 
326 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>