More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0047 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0047  methyltransferase  100 
 
 
328 aa  669    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.509185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2901  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.06 
 
 
332 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00119451  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2729  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.59 
 
 
329 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.763747  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2118  methyltransferase  58.31 
 
 
327 aa  354  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2530  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.23 
 
 
332 aa  348  5e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2510  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.57 
 
 
322 aa  348  6e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.21 
 
 
333 aa  348  8e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.02 
 
 
313 aa  239  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.54 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.91 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.08 
 
 
311 aa  232  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.77 
 
 
312 aa  232  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000544385  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2017  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.56 
 
 
308 aa  229  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4019  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.03 
 
 
310 aa  228  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.219657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1222  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.03 
 
 
310 aa  228  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3964  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.03 
 
 
310 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3677  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.03 
 
 
310 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.03 
 
 
310 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0745363 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4057  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.03 
 
 
310 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2568  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.72 
 
 
310 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.17 
 
 
316 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.03 
 
 
310 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.72 
 
 
310 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000219611  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.17 
 
 
310 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3745  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.41 
 
 
310 aa  225  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.627703  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1296  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.62 
 
 
315 aa  225  8e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1046  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.01 
 
 
311 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3660  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.72 
 
 
310 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1884  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.72 
 
 
310 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0419  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.59 
 
 
313 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0405  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.59 
 
 
313 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.41 
 
 
303 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0394  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.59 
 
 
313 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0393  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.59 
 
 
313 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.27 
 
 
313 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.71 
 
 
313 aa  222  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0320  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.04 
 
 
349 aa  221  9e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000221131  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2708  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.89 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00108828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.64 
 
 
302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0277587 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.22 
 
 
314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3578  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.96 
 
 
313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0378  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.96 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.843738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.96 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187007 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4227  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.96 
 
 
313 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3812  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.53 
 
 
313 aa  220  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0347  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.9 
 
 
313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.790423  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.3 
 
 
353 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0787  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.06 
 
 
309 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0667  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.82 
 
 
313 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.62 
 
 
337 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4541  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.9 
 
 
313 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1985  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.45 
 
 
308 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000115812  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.44 
 
 
307 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2210  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  44.09 
 
 
314 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0172475  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0840  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.12 
 
 
312 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.32 
 
 
398 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.98 
 
 
317 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00084637  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0346  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.99 
 
 
313 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.859571  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3819  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.59 
 
 
315 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.86 
 
 
334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.3 
 
 
351 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.07 
 
 
332 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.19 
 
 
349 aa  216  5e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3461  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.59 
 
 
313 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  41.77 
 
 
349 aa  215  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3196  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.08 
 
 
305 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.421638  decreased coverage  0.00000374346 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.14 
 
 
304 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0935  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.67 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.03 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.61 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.06 
 
 
312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.88 
 
 
311 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.8 
 
 
308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1238  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.88 
 
 
311 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0981  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.63 
 
 
313 aa  212  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.575492  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1668  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.56 
 
 
316 aa  211  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.68 
 
 
337 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0678  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.55 
 
 
313 aa  210  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1139  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.22 
 
 
315 aa  209  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148614  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1444  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.11 
 
 
324 aa  209  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0770792  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2119  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.25 
 
 
310 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1833  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.25 
 
 
310 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0285  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.19 
 
 
315 aa  208  8e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0975  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.93 
 
 
296 aa  208  9e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000346551  normal  0.234872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5180  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.95 
 
 
351 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09570  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.2 
 
 
321 aa  207  1e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.142549 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.9 
 
 
327 aa  208  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09010  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.89 
 
 
311 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08780  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.81 
 
 
318 aa  207  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000136527 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.61 
 
 
306 aa  206  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.51 
 
 
310 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0585  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.92 
 
 
318 aa  206  5e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.59 
 
 
313 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0744  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.44 
 
 
311 aa  206  6e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33376  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3526  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.45 
 
 
320 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.708442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.45 
 
 
320 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2926  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.45 
 
 
320 aa  206  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0559  methyltransferase  40.56 
 
 
314 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000972435  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.57 
 
 
339 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.77 
 
 
313 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>