More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1727 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1727  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
291 aa  591  1e-168  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1787  S-adenosyl-methyltransferase MraW  64.38 
 
 
294 aa  379  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.48 
 
 
299 aa  350  1e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.48 
 
 
299 aa  350  2e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417254  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0865  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.07 
 
 
286 aa  330  1e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.630768  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3196  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.72 
 
 
305 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.421638  decreased coverage  0.00000374346 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1997  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.02 
 
 
283 aa  251  7e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.573092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4816  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.39 
 
 
283 aa  251  8.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.95 
 
 
307 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2119  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.08 
 
 
310 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1833  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.08 
 
 
310 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2017  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.9 
 
 
308 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl394  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.63 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000973738  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1331  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.12 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1572  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.16 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0975  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.94 
 
 
296 aa  237  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000346551  normal  0.234872 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0205  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.18 
 
 
307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.43 
 
 
317 aa  234  9e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00084637  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1991  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.18 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1046  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.19 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.5 
 
 
294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0388  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.78 
 
 
309 aa  233  3e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0708446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.26 
 
 
313 aa  231  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.9 
 
 
301 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09010  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.01 
 
 
311 aa  230  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1238  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.16 
 
 
311 aa  228  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.16 
 
 
311 aa  228  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0163  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.41 
 
 
299 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0366877 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0667  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.04 
 
 
313 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.86 
 
 
312 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4161  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.06 
 
 
304 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0744  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.5 
 
 
311 aa  223  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33376  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  42.02 
 
 
349 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.02 
 
 
349 aa  222  6e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4200  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.06 
 
 
304 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.49 
 
 
312 aa  222  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000544385  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.25 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0285  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.1 
 
 
315 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.34 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.02 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0745363 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3660  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.02 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3677  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.02 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.78 
 
 
303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4057  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.02 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3964  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.02 
 
 
310 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.72 
 
 
308 aa  219  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3637  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.16 
 
 
313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1222  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.56 
 
 
310 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4019  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.56 
 
 
310 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.219657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.02 
 
 
310 aa  218  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.69 
 
 
310 aa  218  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000219611  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.42 
 
 
310 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1653  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.81 
 
 
316 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.489649 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0855  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.06 
 
 
296 aa  218  1e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0122545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.72 
 
 
311 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2568  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.21 
 
 
310 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2460  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.87 
 
 
319 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2732  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.94 
 
 
319 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0320  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.04 
 
 
349 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000221131  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.16 
 
 
313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302053  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.26 
 
 
306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1562  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.75 
 
 
332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3526  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.85 
 
 
320 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.708442  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3097  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.31 
 
 
319 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2926  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.85 
 
 
320 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0455  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.16 
 
 
313 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.85 
 
 
320 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0480  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.16 
 
 
313 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.64263  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3745  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.91 
 
 
310 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.627703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1884  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.78 
 
 
310 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0522  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.51 
 
 
313 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.23 
 
 
316 aa  215  8e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0551  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.51 
 
 
313 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.99 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2708  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.34 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00108828  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0350  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.87 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0981  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.09 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.575492  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2663  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.5 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2436  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.15 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2277  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.91 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.14 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2748  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.2 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.81 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0787  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.42 
 
 
309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1151  SAM-dependent methyltransferase for cell envelope biogenesis  42.77 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1668  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.81 
 
 
316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.12 
 
 
322 aa  212  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835578  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2795  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.91 
 
 
312 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000553872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.88 
 
 
312 aa  212  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  42.44 
 
 
313 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.44 
 
 
313 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.44 
 
 
313 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.8 
 
 
313 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  42.44 
 
 
313 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.44 
 
 
313 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0069  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.19 
 
 
313 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.44 
 
 
313 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.44 
 
 
313 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.44 
 
 
313 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.44 
 
 
313 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>