180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1175 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1175  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  100 
 
 
389 aa  766    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4229  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  49.44 
 
 
836 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4295  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  49.44 
 
 
836 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537586  normal  0.556945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4607  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  48.76 
 
 
836 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1437  Osmosensitive K channel His kinase sensor  48.88 
 
 
854 aa  289  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.429266  normal  0.268919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11046  two component system sensor histidine kinase kdpD  46.05 
 
 
860 aa  288  8e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0599  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  48.33 
 
 
938 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4762  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.47 
 
 
850 aa  282  9e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400421  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3779  Osmosensitive K channel His kinase sensor  48.13 
 
 
857 aa  279  5e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135978  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6794  Osmosensitive K channel His kinase sensor  45.81 
 
 
891 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431431  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3247  Osmosensitive K channel His kinase sensor  45.1 
 
 
853 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27030  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  48.88 
 
 
853 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.553859 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1019  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  46.2 
 
 
858 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0833425  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3283  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  48.17 
 
 
854 aa  270  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331513  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1513  Osmosensitive K channel His kinase sensor  48.04 
 
 
832 aa  268  8.999999999999999e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.919123  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2088  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  46.38 
 
 
384 aa  266  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.510085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  47.78 
 
 
851 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4719  Osmosensitive K channel His kinase sensor  40.17 
 
 
377 aa  262  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1632  Osmosensitive K channel His kinase sensor  44.78 
 
 
844 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0627  osmosensitive K channel His kinase sensor  38.95 
 
 
381 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0355424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0706  sensor histidine kinase KdpD  37.85 
 
 
382 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0742  sensor histidine kinase KdpD  37.85 
 
 
384 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0800  sensor histidine kinase KdpD  38.4 
 
 
381 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.864791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4531  sensor histidine kinase KdpD  37.85 
 
 
381 aa  256  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.797067  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 
900 aa  256  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0812  sensor histidine kinase KdpD  37.85 
 
 
384 aa  256  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0657  osmosensitive K channel His kinase sensor  37.57 
 
 
381 aa  255  7e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0897  sensor histidine kinase KdpD  37.57 
 
 
384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0650  sensor histidine kinase  37.29 
 
 
384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4089  Osmosensitive K channel His kinase sensor  45.35 
 
 
845 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5030  Osmosensitive K channel His kinase sensor  45.35 
 
 
815 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0649  sensor histidine kinase  37.57 
 
 
384 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.831843  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1955  Osmosensitive K channel His kinase sensor  46.23 
 
 
902 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0818  sensor histidine kinase KdpD  37.57 
 
 
381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.23274e-52 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3228  Osmosensitive K channel His kinase sensor  46.91 
 
 
854 aa  252  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1482  Osmosensitive K channel His kinase sensor  42.47 
 
 
731 aa  252  9.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  45.5 
 
 
905 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3494  translation initiation factor IF-2  43.3 
 
 
370 aa  250  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0827  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 
892 aa  249  4e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.23395  normal  0.0418421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3803  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.69 
 
 
846 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109811  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0508  osmosensitive K+ channel, histidine kinase sensor  40.88 
 
 
373 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.831446  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0190  osmosensitive K+ channel histidine kinase sensor subunit  39 
 
 
373 aa  242  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921987  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  42.71 
 
 
902 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 
895 aa  239  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1191  osmosensitive K+ channel histidine kinase sensor subunit  38.63 
 
 
377 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.588152  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1986  sensor kinase for the kdp operon  37.47 
 
 
374 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169225  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0725  Osmosensitive K channel His kinase sensor  45.8 
 
 
391 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 
912 aa  237  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0713  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  47.2 
 
 
867 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 
907 aa  236  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  45.68 
 
 
902 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1878  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.17 
 
 
883 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.759992  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.2 
 
 
887 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 
902 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.88 
 
 
905 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3493  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 
867 aa  234  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.789076  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 
901 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 
897 aa  232  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.02 
 
 
887 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1158  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 
897 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1154  Osmosensitive K channel His kinase sensor  36.81 
 
 
375 aa  231  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0108473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
907 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0381  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  37.36 
 
 
371 aa  229  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000830427  normal  0.0448438 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0896  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  39.12 
 
 
658 aa  229  6e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000123785 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  42.04 
 
 
910 aa  229  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 
905 aa  229  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3249  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.63 
 
 
944 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894868  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2617  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  46.36 
 
 
388 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  41.01 
 
 
895 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2695  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 
897 aa  227  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0787652  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4239  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 
894 aa  227  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1707  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 
849 aa  226  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0056  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  39.37 
 
 
379 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2991  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 
894 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2852  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  41.67 
 
 
365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0711  Osmosensitive K channel His kinase sensor  38.03 
 
 
368 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0684  Osmosensitive K channel His kinase sensor  38.03 
 
 
368 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  45.71 
 
 
905 aa  225  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1680  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 
961 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2050  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
887 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4648  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 
900 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2054  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  45.56 
 
 
949 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414922  normal  0.736885 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0254  Osmosensitive K channel His kinase sensor  41.77 
 
 
754 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  40.33 
 
 
902 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1099  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
896 aa  224  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  40.58 
 
 
908 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  40.58 
 
 
908 aa  224  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1746  Osmosensitive K channel His kinase sensor  41.62 
 
 
553 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2245  sensor protein KdpD  39.27 
 
 
887 aa  222  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4030  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
883 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  42.44 
 
 
894 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  40.32 
 
 
908 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  42.15 
 
 
895 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 
894 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  42.15 
 
 
894 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1971  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  35.42 
 
 
374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.195386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  42.15 
 
 
894 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  42.15 
 
 
894 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2961  sensor protein KdpD  42.15 
 
 
895 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  42.15 
 
 
894 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>