41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3074 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3074  virulence protein, SciE type  100 
 
 
271 aa  527  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1532  hypothetical protein  37.25 
 
 
277 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3028  virulence protein, SciE type  39.38 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0281455  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6048  hypothetical protein  34.65 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01040  putative secretion protein  33.33 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000023  protein of avirulence locus ImpE  30.59 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.692484  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2366  virulence protein, SciE type  27.24 
 
 
262 aa  119  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0158  virulence protein, SciE type  34.41 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2327  virulence protein, SciE type  32.43 
 
 
261 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0365801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0525  virulence protein SciE type  31.45 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1478  virulence protein, SciE type  28.69 
 
 
285 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00263  ImpE protein  31.84 
 
 
277 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2453  virulence protein SciE type  29.34 
 
 
275 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0611141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3856  virulence protein SciE type  26.82 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271888  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0174  ImpE/SciE family protein  30.62 
 
 
268 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0152  ImpE/SciE family protein  30.62 
 
 
268 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1623  SciE protein  30.62 
 
 
284 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1686  virulence protein SciE type  27.76 
 
 
275 aa  89  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.207214  normal  0.113631 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0300  SciE protein  27.48 
 
 
274 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3010  virulence protein SciE type  31.2 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177005  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3009  virulence protein SciE type  27.21 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0293  SciE protein  27 
 
 
274 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.816472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0295  SciE protein  27 
 
 
274 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.227917 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0308  hypothetical protein  27 
 
 
274 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.914397 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0138  ImpE protein superfamily protein  31.35 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6691  virulence protein SciE type  30.04 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3471  virulence protein, SciE type  29.57 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  0.687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0977  virulence protein, SciE type  30.77 
 
 
284 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1931  hypothetical protein  27.94 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.350891  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1377  ImpE family protein  27.94 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1489  virulence protein SciE type  27.57 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747548  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0196  virulence protein SciE type  28.63 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6117  virulence protein SciE type  27.97 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal  0.445465 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0944  virulence protein SciE type  27.49 
 
 
290 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0246  ImpE/SciE family protein  30.88 
 
 
321 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1698  ImpE protein superfamily protein  30.88 
 
 
321 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0337  ImpE/SciE family protein  30.88 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1906  hypothetical protein  28.79 
 
 
321 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2179  ImpE/SciE family protein  28.79 
 
 
321 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1204  hypothetical protein  28.79 
 
 
321 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0917  hypothetical protein  28.79 
 
 
321 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>