41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2327 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2327  virulence protein, SciE type  100 
 
 
261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0365801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01040  putative secretion protein  74.61 
 
 
281 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0158  virulence protein, SciE type  73.64 
 
 
261 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0525  virulence protein SciE type  50.78 
 
 
278 aa  251  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1478  virulence protein, SciE type  47.81 
 
 
285 aa  237  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3856  virulence protein SciE type  45.91 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271888  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00263  ImpE protein  39.15 
 
 
277 aa  182  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0977  virulence protein, SciE type  39.31 
 
 
284 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6117  virulence protein SciE type  38.19 
 
 
288 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal  0.445465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3009  virulence protein SciE type  40 
 
 
271 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3010  virulence protein SciE type  40.71 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177005  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1686  virulence protein SciE type  38.67 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.207214  normal  0.113631 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0293  SciE protein  37.07 
 
 
274 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.816472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0295  SciE protein  37.07 
 
 
274 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.227917 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0308  hypothetical protein  36.68 
 
 
274 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.914397 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0300  SciE protein  36.68 
 
 
274 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3471  virulence protein, SciE type  36.4 
 
 
283 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  0.687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0944  virulence protein SciE type  35.77 
 
 
290 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1489  virulence protein SciE type  35.63 
 
 
268 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747548  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1931  hypothetical protein  35.63 
 
 
268 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.350891  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1377  ImpE family protein  35.63 
 
 
268 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0174  ImpE/SciE family protein  36.08 
 
 
268 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0152  ImpE/SciE family protein  36.08 
 
 
268 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1623  SciE protein  36.08 
 
 
284 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0138  ImpE protein superfamily protein  36.08 
 
 
284 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6691  virulence protein SciE type  37.45 
 
 
286 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0246  ImpE/SciE family protein  34.73 
 
 
321 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1698  ImpE protein superfamily protein  34.73 
 
 
321 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0337  ImpE/SciE family protein  34.1 
 
 
321 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2453  virulence protein SciE type  33.84 
 
 
275 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0611141  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2179  ImpE/SciE family protein  33.33 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1204  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0917  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1906  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306251  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0196  virulence protein SciE type  35.21 
 
 
288 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3074  virulence protein, SciE type  32.43 
 
 
271 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1532  hypothetical protein  31.13 
 
 
277 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000023  protein of avirulence locus ImpE  28.11 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.692484  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2366  virulence protein, SciE type  25.65 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6048  hypothetical protein  28.4 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3028  virulence protein, SciE type  28.84 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0281455  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>