38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0917 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1906  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0917  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1204  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2179  ImpE/SciE family protein  100 
 
 		 321 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1698  ImpE protein superfamily protein  97.2 
 
 		 321 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0246  ImpE/SciE family protein  97.2 
 
 		 321 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0337  ImpE/SciE family protein  97.51 
 
 		 321 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6117  virulence protein SciE type  52.72 
 
 		 288 aa  292  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal  0.445465 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3471  virulence protein, SciE type  52.8 
 
 		 283 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  0.687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0977  virulence protein, SciE type  48.36 
 
 		 284 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0944  virulence protein SciE type  49.82 
 
 		 290 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3010  virulence protein SciE type  44.2 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6691  virulence protein SciE type  40.27 
 
 		 286 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1686  virulence protein SciE type  38.46 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.207214  normal  0.113631 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1623  SciE protein  40.3 
 
 		 284 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0152  ImpE/SciE family protein  40.3 
 
 		 268 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0174  ImpE/SciE family protein  40.3 
 
 		 268 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0138  ImpE protein superfamily protein  39.92 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0293  SciE protein  38.01 
 
 		 274 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.816472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0300  SciE protein  38.01 
 
 		 274 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0308  hypothetical protein  38.99 
 
 		 274 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.914397 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0295  SciE protein  38.01 
 
 		 274 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.227917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1478  virulence protein, SciE type  37.45 
 
 		 285 aa  177  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0158  virulence protein, SciE type  36.13 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01040  putative secretion protein  36.4 
 
 		 281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3856  virulence protein SciE type  35.51 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2327  virulence protein, SciE type  34.91 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0365801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0525  virulence protein SciE type  33.93 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1377  ImpE family protein  30.29 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1489  virulence protein SciE type  30.29 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747548  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1931  hypothetical protein  30.29 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.350891  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3009  virulence protein SciE type  32.16 
 
 		 271 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00263  ImpE protein  33.21 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2453  virulence protein SciE type  28.88 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0611141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0196  virulence protein SciE type  26.99 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1532  hypothetical protein  30.16 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2366  virulence protein, SciE type  23.02 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000023  protein of avirulence locus ImpE  24.62 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.692484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>