40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0174 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1623  SciE protein  100 
 
 
284 aa  540  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0174  ImpE/SciE family protein  100 
 
 
268 aa  540  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0152  ImpE/SciE family protein  100 
 
 
268 aa  540  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0138  ImpE protein superfamily protein  94.78 
 
 
284 aa  494  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3010  virulence protein SciE type  71.27 
 
 
284 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177005  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6691  virulence protein SciE type  70.79 
 
 
286 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1686  virulence protein SciE type  46.56 
 
 
275 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.207214  normal  0.113631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0977  virulence protein, SciE type  42.86 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3471  virulence protein, SciE type  40.87 
 
 
283 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  0.687 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0308  hypothetical protein  41.06 
 
 
274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.914397 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0293  SciE protein  41.06 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.816472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0295  SciE protein  40.68 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.227917 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0300  SciE protein  41.77 
 
 
274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6117  virulence protein SciE type  40.56 
 
 
288 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal  0.445465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1478  virulence protein, SciE type  41.25 
 
 
285 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0944  virulence protein SciE type  40.98 
 
 
290 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1377  ImpE family protein  39 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1931  hypothetical protein  39 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.350891  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1489  virulence protein SciE type  38.61 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0337  ImpE/SciE family protein  40.31 
 
 
321 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0246  ImpE/SciE family protein  39.92 
 
 
321 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1698  ImpE protein superfamily protein  39.92 
 
 
321 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3856  virulence protein SciE type  40.71 
 
 
269 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271888  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1906  hypothetical protein  39.53 
 
 
321 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2179  ImpE/SciE family protein  39.53 
 
 
321 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1204  hypothetical protein  39.53 
 
 
321 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0917  hypothetical protein  39.53 
 
 
321 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0525  virulence protein SciE type  36.08 
 
 
278 aa  158  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0158  virulence protein, SciE type  38.11 
 
 
261 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01040  putative secretion protein  37.89 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2327  virulence protein, SciE type  36.08 
 
 
261 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0365801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3009  virulence protein SciE type  29.84 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00263  ImpE protein  34.31 
 
 
277 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2453  virulence protein SciE type  29.26 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0611141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0196  virulence protein SciE type  26.15 
 
 
288 aa  89.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2366  virulence protein, SciE type  28.39 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000023  protein of avirulence locus ImpE  26.03 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.692484  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1532  hypothetical protein  29.32 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3074  virulence protein, SciE type  28.4 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6048  hypothetical protein  29.03 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>