More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3012 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3012  aspartate kinase  100 
 
 
488 aa  978    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.844971  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2953  aspartate kinase  65.83 
 
 
480 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.125059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0149  aspartate kinase  52.46 
 
 
485 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1029  aspartate kinase  51.39 
 
 
480 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0554  aspartate kinase  52.51 
 
 
478 aa  480  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.56437  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1162  aspartate kinase  50.64 
 
 
481 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.546114  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1192  aspartate kinase  48.93 
 
 
477 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.670085 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0959  aspartate kinase  46.68 
 
 
470 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.209402  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0521  aspartate kinase  47.87 
 
 
507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02451  aspartate kinase  44.59 
 
 
474 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0412  aspartate kinase  44.04 
 
 
474 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000111891  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003602  aspartokinase associated with ectoin biosynthesis  43.25 
 
 
473 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2045  aspartate kinase  40.68 
 
 
465 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0654189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2001  aspartate kinase  41.51 
 
 
463 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1815  aspartate kinase  40.68 
 
 
465 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2115  aspartate kinase  40.47 
 
 
465 aa  343  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0840008  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0587  aspartate kinase  41.72 
 
 
466 aa  341  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.525939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3243  aspartate kinase  39.35 
 
 
460 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1347  aspartate kinase  39.22 
 
 
470 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0442684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.55 
 
 
819 aa  113  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.55 
 
 
823 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  27.27 
 
 
478 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0142  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.35 
 
 
820 aa  107  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000979597  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1127  aspartate kinase  27.25 
 
 
470 aa  104  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.892413  hitchhiker  0.00887106 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  27.36 
 
 
823 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1820  aspartate kinase  29.48 
 
 
466 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000320312  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  26.98 
 
 
467 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  26.15 
 
 
468 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.07 
 
 
819 aa  99.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1980  aspartate kinase  25.15 
 
 
469 aa  99.8  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0255525  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2330  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.67 
 
 
822 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  24.38 
 
 
465 aa  98.2  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  24.3 
 
 
468 aa  98.2  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  24.9 
 
 
815 aa  97.8  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  23.53 
 
 
468 aa  97.1  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  22.7 
 
 
468 aa  95.5  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  27.15 
 
 
467 aa  94  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  26.23 
 
 
465 aa  94  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.76 
 
 
819 aa  93.2  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  24.63 
 
 
462 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2542  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  24.47 
 
 
815 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.573411  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1754  aspartate kinase  26.03 
 
 
467 aa  88.2  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  24.19 
 
 
814 aa  86.3  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  22.85 
 
 
815 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1449  aspartate kinase, monofunctional class  30.03 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  23.25 
 
 
818 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22113  bifunctional aspartokinase  25.88 
 
 
870 aa  78.6  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  21.31 
 
 
817 aa  77.8  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16060  aspartate kinase  28.15 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  hitchhiker  0.000000275523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1494  aspartate kinase  22.25 
 
 
804 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  22.76 
 
 
818 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0541  aspartate kinase  23.15 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116539  hitchhiker  0.00000501097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  24.02 
 
 
462 aa  74.3  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.39 
 
 
834 aa  73.9  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0411  aspartate kinase  25 
 
 
804 aa  73.6  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.204569  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08859  aspartate kinase, putative (Eurofung)  23.06 
 
 
525 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.777655  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  22.08 
 
 
465 aa  72.4  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0843  aspartate kinase  24.33 
 
 
468 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.7 
 
 
835 aa  71.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  21.73 
 
 
472 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1230  aspartate kinase  27.61 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  24.45 
 
 
859 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  24.45 
 
 
859 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  23.2 
 
 
541 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02030  aspartate kinase, putative  26.63 
 
 
654 aa  68.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.4958  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0087  aspartate kinase  23.81 
 
 
465 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0531987  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  24.82 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69242  aspartate kinase (L-aspartate 4-P- transferase)  29.03 
 
 
536 aa  67.8  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  26.62 
 
 
878 aa  67.4  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1425  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  24.47 
 
 
835 aa  67  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  20.63 
 
 
815 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  26.45 
 
 
407 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  25.75 
 
 
857 aa  65.1  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1358  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  24.08 
 
 
835 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  24.24 
 
 
455 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  21.96 
 
 
469 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2031  aspartate kinase  26.54 
 
 
469 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.296392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  21.62 
 
 
437 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  25.39 
 
 
864 aa  61.6  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1079  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  23.73 
 
 
822 aa  62  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.555098 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  24.64 
 
 
449 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  24.64 
 
 
449 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  24.64 
 
 
449 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  24.64 
 
 
449 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  25.69 
 
 
405 aa  60.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  25.19 
 
 
405 aa  60.8  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1067  aspartate kinase I  32.26 
 
 
413 aa  60.5  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  24.64 
 
 
449 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1940  aspartate kinase I  25 
 
 
408 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.604323  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  24.69 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2352  aspartate kinase  22.79 
 
 
444 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000453597  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  21.41 
 
 
456 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1066  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  22.26 
 
 
821 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44504  predicted protein  22.28 
 
 
463 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  21.78 
 
 
820 aa  59.3  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  21.8 
 
 
818 aa  58.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0142  aspartate kinase  22.64 
 
 
463 aa  58.5  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  21.97 
 
 
471 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3005  aspartate kinase  24.43 
 
 
469 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1128  aspartate kinase  26.4 
 
 
418 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000633865  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>