More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1128 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3427  aspartokinase  96.41 
 
 		 418 aa  786    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2744  aspartate kinase  89.95 
 
 		 418 aa  737    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00631887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3266  aspartate kinase  88.28 
 
 		 418 aa  711    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00158192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3123  aspartate kinase  88.04 
 
 		 418 aa  709    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00206455  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3114  aspartate kinase  88.28 
 
 		 418 aa  711    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000131076  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1128  aspartate kinase  100 
 
 		 418 aa  840    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000633865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1199  aspartate kinase  99.76 
 
 		 418 aa  835    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000597152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1129  aspartate kinase  98.8 
 
 		 418 aa  827    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1251  aspartate kinase  88.52 
 
 		 418 aa  713    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000231974  hitchhiker  0.00000000112827 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1049  aspartate kinase  57.42 
 
 		 403 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00683315  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  48.52 
 
 		 413 aa  362  7.0000000000000005e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  48.65 
 
 		 411 aa  351  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  47.79 
 
 		 408 aa  352  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  48.28 
 
 		 412 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  48.28 
 
 		 412 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  51.11 
 
 		 412 aa  349  5e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  48.15 
 
 		 410 aa  348  7e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  48.15 
 
 		 410 aa  348  8e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  48.15 
 
 		 411 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  48.17 
 
 		 414 aa  345  8e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  47.9 
 
 		 411 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  48.89 
 
 		 410 aa  345  1e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  47.92 
 
 		 409 aa  343  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  47.47 
 
 		 424 aa  343  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  47.65 
 
 		 411 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  47.65 
 
 		 411 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  50 
 
 		 409 aa  339  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  47.43 
 
 		 413 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  47.33 
 
 		 408 aa  333  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  48.89 
 
 		 414 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  44.15 
 
 		 428 aa  326  6e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  43.91 
 
 		 428 aa  325  7e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  46.6 
 
 		 408 aa  325  9e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  46.6 
 
 		 413 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  44.96 
 
 		 406 aa  318  7.999999999999999e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  47.54 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  44.26 
 
 		 427 aa  318  1e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  47.67 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  47.79 
 
 		 416 aa  317  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  47.67 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2511  aspartate kinase  47.04 
 
 		 421 aa  316  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.628463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  46.55 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  46.83 
 
 		 409 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2452  aspartate kinase  45.97 
 
 		 453 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  46.91 
 
 		 416 aa  312  9e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  46.79 
 
 		 422 aa  311  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  46.53 
 
 		 410 aa  310  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3086  aspartate kinase  46.08 
 
 		 422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4940  aspartate kinase  46.1 
 
 		 422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2324  aspartate kinase  48.22 
 
 		 423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  hitchhiker  0.000104056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1674  aspartate kinase  45.28 
 
 		 422 aa  307  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1628  aspartate kinase  46.57 
 
 		 422 aa  307  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2086  aspartate kinase  46.57 
 
 		 422 aa  307  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0950022  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0991  aspartokinase  45.32 
 
 		 409 aa  305  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000471315  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2889  aspartate kinase  46.57 
 
 		 422 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428464  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  43.24 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2860  aspartate kinase  47.51 
 
 		 422 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0862  aspartate kinase  46.3 
 
 		 416 aa  303  5.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  41.03 
 
 		 427 aa  303  5.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  45.1 
 
 		 405 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0884  aspartate kinase  45.07 
 
 		 409 aa  300  2e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000166262  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0976  aspartate kinase  46.54 
 
 		 416 aa  300  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1386  aspartate kinase  44.39 
 
 		 416 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0459009  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0074  aspartate kinase  45.41 
 
 		 395 aa  300  4e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101932  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1141  aspartate kinase  42.05 
 
 		 411 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2540  aspartate kinase  44.39 
 
 		 416 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5380  aspartate kinase  44.39 
 
 		 417 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197228  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1945  aspartate kinase  43.91 
 
 		 416 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2154  aspartate kinase  44.15 
 
 		 416 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1427  aspartate kinase  44.15 
 
 		 416 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1652  aspartate kinase  44.15 
 
 		 416 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2677  aspartate kinase  44.15 
 
 		 416 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  43.6 
 
 		 410 aa  293  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3161  aspartate kinase  44.15 
 
 		 416 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40885  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2591  aspartate kinase  44.15 
 
 		 416 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1207  aspartate kinase  44.39 
 
 		 416 aa  292  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629425  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  41.56 
 
 		 400 aa  290  2e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6003  aspartate kinase  43.63 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2074  aspartate kinase  43.63 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1979  aspartate kinase  43.81 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2093  aspartate kinase  43.63 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1630  aspartate kinase  43.91 
 
 		 416 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000735102  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  42.51 
 
 		 407 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1089  aspartate kinase  45.71 
 
 		 416 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023583  hitchhiker  0.00464797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  45.45 
 
 		 410 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2506  aspartate kinase  43.91 
 
 		 416 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0261079  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1012  aspartate kinase  44.63 
 
 		 416 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.173113  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1106  aspartate kinase  44.63 
 
 		 416 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.736404  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1126  aspartate kinase  45.58 
 
 		 416 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00000763531  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  41.94 
 
 		 409 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0787  aspartate kinase  42.29 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  43.77 
 
 		 407 aa  286  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002522  aspartokinase  43.46 
 
 		 395 aa  286  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000343675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1623  aspartate kinase  44.89 
 
 		 409 aa  286  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1932  aspartate kinase  45.14 
 
 		 409 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03510  aspartate kinase  42.79 
 
 		 395 aa  286  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1658  aspartate kinase  44.89 
 
 		 409 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404901  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2109  aspartate kinase  43.81 
 
 		 417 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  42.72 
 
 		 405 aa  285  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  42.61 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>