More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2352 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2352  aspartate kinase  100 
 
 		 444 aa  909    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000453597  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0541  aspartate kinase  48.39 
 
 		 442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116539  hitchhiker  0.00000501097 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16060  aspartate kinase  48.42 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  hitchhiker  0.000000275523 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1415  aspartate kinase  43.18 
 
 		 460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000337158  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1388  aspartate kinase  43.18 
 
 		 460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0011812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1375  aspartate kinase  44.52 
 
 		 449 aa  335  7e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000974637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3141  aspartate kinase  44.37 
 
 		 458 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000375152  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0528  aspartate kinase  41.7 
 
 		 454 aa  332  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000180899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3293  aspartate kinase  42.92 
 
 		 458 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0339  aspartate kinase  41.58 
 
 		 450 aa  328  9e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.893202  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0784  aspartate kinase  40.27 
 
 		 451 aa  328  2.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0896  aspartate kinase  40.9 
 
 		 458 aa  322  6e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0170184  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1540  aspartate kinase  42.06 
 
 		 452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0425  aspartate kinase  40.71 
 
 		 452 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0611  aspartate kinase  38.89 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0132396  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0783  aspartate kinase  39.39 
 
 		 450 aa  299  8e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.016394  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1078  aspartate kinase  36.61 
 
 		 451 aa  293  6e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0935045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1544  aspartate kinase  36.32 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  31.42 
 
 		 815 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  28.82 
 
 		 819 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.36 
 
 		 818 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00939  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.39 
 
 		 819 aa  171  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  30.22 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  28.99 
 
 		 818 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3863  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.33 
 
 		 819 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3668  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.33 
 
 		 819 aa  167  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.39 
 
 		 823 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.57 
 
 		 820 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.56 
 
 		 820 aa  166  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3653  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.56 
 
 		 820 aa  166  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.56 
 
 		 820 aa  166  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.761608  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00002  bifunctional aspartokinase I/homoserine dehydrogenase I  27.56 
 
 		 820 aa  166  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.843244  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3594  aspartate kinase  27.56 
 
 		 820 aa  166  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00002  hypothetical protein  27.56 
 
 		 820 aa  166  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.964701  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.56 
 
 		 820 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.880494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.56 
 
 		 820 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.54 
 
 		 818 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.85 
 
 		 819 aa  164  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  28.69 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.41 
 
 		 818 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1943  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.52 
 
 		 819 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0938577  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0683  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.12 
 
 		 819 aa  164  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000368651  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.66 
 
 		 815 aa  162  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  29.27 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  25.87 
 
 		 823 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  30.06 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.46 
 
 		 820 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0808  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.09 
 
 		 819 aa  161  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.693104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3604  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.09 
 
 		 819 aa  161  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.331342  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3476  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.09 
 
 		 819 aa  161  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  28.51 
 
 		 814 aa  160  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  29.26 
 
 		 468 aa  160  5e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.09 
 
 		 815 aa  159  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.5 
 
 		 820 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.5 
 
 		 820 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.5 
 
 		 820 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  29.05 
 
 		 467 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2556  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.48 
 
 		 819 aa  158  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  26.74 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.5 
 
 		 820 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0142  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.85 
 
 		 820 aa  157  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000979597  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.28 
 
 		 820 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0437927  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  26.64 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  27.71 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.79 
 
 		 817 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.06 
 
 		 819 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0564  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.18 
 
 		 820 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  27.55 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  26.71 
 
 		 437 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  30.08 
 
 		 468 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2542  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.94 
 
 		 815 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.573411  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  29.98 
 
 		 465 aa  153  7e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1127  aspartate kinase  31.29 
 
 		 470 aa  153  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.892413  hitchhiker  0.00887106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5632  aspartate kinase  28.44 
 
 		 441 aa  153  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000704481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  27.41 
 
 		 471 aa  152  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.14 
 
 		 818 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.13 
 
 		 819 aa  152  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  29.75 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  30.64 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2330  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.9 
 
 		 822 aa  151  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  29.81 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1358  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.98 
 
 		 835 aa  150  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03328  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.02 
 
 		 804 aa  149  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.51 
 
 		 835 aa  149  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.14 
 
 		 834 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  26 
 
 		 471 aa  149  9e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1754  aspartate kinase  25.26 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  27.33 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  28.35 
 
 		 541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1066  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.3 
 
 		 821 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1270  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.81 
 
 		 821 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.739227  hitchhiker  0.00698149 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1079  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.9 
 
 		 822 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.555098 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25490  aspartate kinase  29.89 
 
 		 450 aa  147  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  27.99 
 
 		 462 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  27.39 
 
 		 471 aa  147  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3817  aspartate kinase  29.33 
 
 		 452 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00114248  normal  0.367639 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1425  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.34 
 
 		 835 aa  144  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1175  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.71 
 
 		 821 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2740  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.66 
 
 		 825 aa  143  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.63 
 
 		 822 aa  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>