More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0896 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0896  aspartate kinase  100 
 
 		 458 aa  933    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0170184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1388  aspartate kinase  81.84 
 
 		 460 aa  772    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0011812  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1415  aspartate kinase  81.84 
 
 		 460 aa  772    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000337158  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3293  aspartate kinase  51.63 
 
 		 458 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3141  aspartate kinase  51.64 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000375152  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0528  aspartate kinase  50.11 
 
 		 454 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000180899  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0339  aspartate kinase  47.67 
 
 		 450 aa  437  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.893202  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0425  aspartate kinase  47.88 
 
 		 452 aa  434  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1375  aspartate kinase  48.43 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000974637  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1540  aspartate kinase  46.55 
 
 		 452 aa  426  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0783  aspartate kinase  47.33 
 
 		 450 aa  408  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.016394  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1544  aspartate kinase  46.43 
 
 		 479 aa  394  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0611  aspartate kinase  42.95 
 
 		 452 aa  378  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0132396  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1078  aspartate kinase  43.33 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0935045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0784  aspartate kinase  43.95 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2352  aspartate kinase  40.9 
 
 		 444 aa  322  7e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000453597  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0541  aspartate kinase  36.36 
 
 		 442 aa  282  1e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116539  hitchhiker  0.00000501097 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16060  aspartate kinase  33.11 
 
 		 458 aa  249  6e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  hitchhiker  0.000000275523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  28.39 
 
 		 465 aa  169  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.88 
 
 		 819 aa  167  5e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0142  aspartate kinase  29.06 
 
 		 463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  30.27 
 
 		 468 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  25.22 
 
 		 450 aa  163  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.4 
 
 		 820 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  26.32 
 
 		 456 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00939  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.69 
 
 		 819 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  25.05 
 
 		 450 aa  160  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  29.32 
 
 		 468 aa  160  6e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1358  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.17 
 
 		 835 aa  159  7e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.47 
 
 		 820 aa  159  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.21 
 
 		 815 aa  159  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  29.5 
 
 		 468 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.06 
 
 		 819 aa  158  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2556  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.21 
 
 		 819 aa  158  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03328  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.36 
 
 		 804 aa  158  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  26.05 
 
 		 819 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  25.77 
 
 		 451 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1425  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.22 
 
 		 835 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  29.12 
 
 		 462 aa  157  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  29.44 
 
 		 468 aa  156  7e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  28.2 
 
 		 462 aa  156  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  26.79 
 
 		 818 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1943  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.85 
 
 		 819 aa  154  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0938577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.08 
 
 		 820 aa  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.880494  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00002  bifunctional aspartokinase I/homoserine dehydrogenase I  27.08 
 
 		 820 aa  153  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.843244  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3594  aspartate kinase  27.08 
 
 		 820 aa  153  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00002  hypothetical protein  27.08 
 
 		 820 aa  153  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.964701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3653  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.08 
 
 		 820 aa  152  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.79 
 
 		 820 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.79 
 
 		 820 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.761608  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.08 
 
 		 820 aa  152  8.999999999999999e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  26.62 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.17 
 
 		 822 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  28.06 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  25.32 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1820  aspartate kinase  28.72 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000320312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0683  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.59 
 
 		 819 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000368651  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.17 
 
 		 822 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.17 
 
 		 822 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.64 
 
 		 822 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.17 
 
 		 822 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  29.98 
 
 		 465 aa  150  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.96 
 
 		 822 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.58 
 
 		 822 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  26.58 
 
 		 471 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3476  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.89 
 
 		 819 aa  150  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0808  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.89 
 
 		 819 aa  150  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.693104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.79 
 
 		 818 aa  150  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3604  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.89 
 
 		 819 aa  150  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.331342  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0564  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.78 
 
 		 820 aa  149  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.69 
 
 		 820 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0437927  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.89 
 
 		 819 aa  149  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.96 
 
 		 822 aa  149  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1079  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  24.26 
 
 		 822 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.555098 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.88 
 
 		 818 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  24.26 
 
 		 823 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.91 
 
 		 817 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.48 
 
 		 820 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.48 
 
 		 820 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.48 
 
 		 820 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1754  aspartate kinase  25.54 
 
 		 467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  25.54 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  24.89 
 
 		 478 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2906  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.7 
 
 		 821 aa  147  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  25.88 
 
 		 471 aa  146  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.48 
 
 		 820 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3863  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.79 
 
 		 819 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.64 
 
 		 822 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1175  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  24.46 
 
 		 821 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3668  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.79 
 
 		 819 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  26.79 
 
 		 465 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2542  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.27 
 
 		 815 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.573411  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  29.72 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.203177 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.16 
 
 		 818 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  26.77 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  26.21 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.06 
 
 		 823 aa  143  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1066  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  24.95 
 
 		 821 aa  142  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  28.5 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  24.2 
 
 		 541 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>