More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16060 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16060  aspartate kinase  100 
 
 
458 aa  935    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  hitchhiker  0.000000275523 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0541  aspartate kinase  60.45 
 
 
442 aa  563  1.0000000000000001e-159  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116539  hitchhiker  0.00000501097 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2352  aspartate kinase  48.42 
 
 
444 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000453597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3141  aspartate kinase  37.34 
 
 
458 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000375152  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1415  aspartate kinase  34.3 
 
 
460 aa  263  6e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000337158  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1540  aspartate kinase  36.78 
 
 
452 aa  263  6e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1388  aspartate kinase  34.3 
 
 
460 aa  263  6e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0011812  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1078  aspartate kinase  34.73 
 
 
451 aa  258  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0935045  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0783  aspartate kinase  34.95 
 
 
450 aa  257  4e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.016394  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1375  aspartate kinase  37.03 
 
 
449 aa  256  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000974637  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0339  aspartate kinase  35.93 
 
 
450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.893202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0528  aspartate kinase  36.78 
 
 
454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000180899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3293  aspartate kinase  35.68 
 
 
458 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0896  aspartate kinase  33.11 
 
 
458 aa  249  6e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0170184  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0784  aspartate kinase  34.89 
 
 
451 aa  244  3e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0611  aspartate kinase  33.63 
 
 
452 aa  236  6e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0132396  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0425  aspartate kinase  33.26 
 
 
452 aa  233  6e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1544  aspartate kinase  32.42 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  29.54 
 
 
468 aa  176  8e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.24 
 
 
820 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  30.32 
 
 
815 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.52 
 
 
819 aa  172  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0142  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.13 
 
 
820 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000979597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.41 
 
 
819 aa  170  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  29.56 
 
 
814 aa  169  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  27.22 
 
 
471 aa  168  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.54 
 
 
815 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0683  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.08 
 
 
819 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000368651  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3476  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.05 
 
 
819 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3604  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.05 
 
 
819 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.331342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0808  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.05 
 
 
819 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  28.57 
 
 
823 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.24 
 
 
819 aa  166  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00002  bifunctional aspartokinase I/homoserine dehydrogenase I  30.13 
 
 
820 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.843244  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00002  hypothetical protein  30.13 
 
 
820 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.964701  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  28.93 
 
 
468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.13 
 
 
820 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.880494  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3653  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.13 
 
 
820 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.13 
 
 
820 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.13 
 
 
820 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.761608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3594  aspartate kinase  30.13 
 
 
820 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.08 
 
 
820 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.13 
 
 
820 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.08 
 
 
820 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.08 
 
 
820 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186418  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.08 
 
 
820 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0437927  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2542  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.69 
 
 
815 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.573411  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1079  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.36 
 
 
822 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.555098 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.08 
 
 
820 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  28.48 
 
 
471 aa  163  8.000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  28.72 
 
 
468 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.24 
 
 
818 aa  162  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  28.93 
 
 
468 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0564  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.5 
 
 
820 aa  162  9e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.17 
 
 
818 aa  162  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726282  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  29.03 
 
 
471 aa  162  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  27.35 
 
 
437 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.45 
 
 
817 aa  160  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.95 
 
 
823 aa  160  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  27.93 
 
 
819 aa  160  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.93 
 
 
818 aa  160  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  28.85 
 
 
469 aa  160  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.59 
 
 
815 aa  160  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  28.87 
 
 
818 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3863  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.45 
 
 
819 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3668  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.45 
 
 
819 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  28.1 
 
 
465 aa  158  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1066  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.45 
 
 
821 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  33.22 
 
 
471 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  27.58 
 
 
471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2740  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.78 
 
 
825 aa  156  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363981  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2330  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.32 
 
 
822 aa  156  8e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.83 
 
 
818 aa  156  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.4 
 
 
822 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  28.21 
 
 
471 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  29.46 
 
 
465 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.4 
 
 
822 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.4 
 
 
822 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.4 
 
 
822 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.4 
 
 
822 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2906  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  24.84 
 
 
821 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.94 
 
 
822 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  29.75 
 
 
465 aa  154  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00939  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.29 
 
 
819 aa  154  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1943  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.6 
 
 
819 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0938577  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2556  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.85 
 
 
819 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.6 
 
 
822 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.6 
 
 
822 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  26.62 
 
 
471 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.12 
 
 
822 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  28.85 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.81 
 
 
820 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0905  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.98 
 
 
821 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08859  aspartate kinase, putative (Eurofung)  27.33 
 
 
525 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.777655  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6874  aspartate kinase  24.95 
 
 
440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.52096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3817  aspartate kinase  26.51 
 
 
452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00114248  normal  0.367639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1270  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.85 
 
 
821 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.739227  hitchhiker  0.00698149 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22113  bifunctional aspartokinase  27.35 
 
 
870 aa  147  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1820  aspartate kinase  28 
 
 
466 aa  147  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000320312  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5632  aspartate kinase  26.85 
 
 
441 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000704481  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>