78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3809 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3809  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  100 
 
 
326 aa  662    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0132  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  35.81 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0417  hypothetical protein  34.84 
 
 
308 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4278  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  33.66 
 
 
309 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  hitchhiker  0.00544084 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0525  hypothetical protein  31.75 
 
 
332 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0543  hypothetical protein  31.75 
 
 
332 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0710  hypothetical protein  31.75 
 
 
332 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0130  hypothetical protein  31.69 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1458  hypothetical protein  31.69 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2886  hypothetical protein  31.69 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3160  hypothetical protein  31.69 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5647  hypothetical protein  32.53 
 
 
327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210784  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6012  hypothetical protein  32.53 
 
 
327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139074  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6503  hypothetical protein  32.18 
 
 
327 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57028 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6140  hypothetical protein  30.96 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0927717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3802  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  28.8 
 
 
316 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7421  hypothetical protein  30.85 
 
 
329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.399758  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0138  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.93 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0423  hypothetical protein  27.55 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4272  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  26.84 
 
 
311 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351964  hitchhiker  0.000234797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3882  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  26.21 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.264087  normal  0.0481664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0422  beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  27.41 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3263  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  26.01 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0484  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  23.55 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305629  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3414  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  23.57 
 
 
322 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0990  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  30.77 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3097  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  24.58 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3948  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  23.31 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877471  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0418  hypothetical protein  29.75 
 
 
330 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07545  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  23.89 
 
 
335 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4310  hypothetical protein  25.42 
 
 
311 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944939  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1601  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  21.77 
 
 
320 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0233634  normal  0.552006 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3501  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.8 
 
 
316 aa  50.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246754  decreased coverage  0.00135682 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1684  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.8 
 
 
316 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000249118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1576  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.8 
 
 
316 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.70406e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1605  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.97 
 
 
310 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3556  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  26.62 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.896137  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2367  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000811483 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0518  hypothetical protein  22.69 
 
 
342 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.397624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6312  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  25.88 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1192  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.01 
 
 
324 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0133  hypothetical protein  32.35 
 
 
353 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1585  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.71 
 
 
316 aa  47  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421947  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002994  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase KASIII  26.95 
 
 
316 aa  47  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000798745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4941  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  23.91 
 
 
312 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1784  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  25.46 
 
 
326 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.344205 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02910  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.11 
 
 
316 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2750  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  31.87 
 
 
326 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2842  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  31.87 
 
 
326 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.61653  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2934  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  29.47 
 
 
326 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2466  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.51 
 
 
326 aa  46.2  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00040631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.95 
 
 
333 aa  46.2  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1082  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.03 
 
 
310 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1609  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.89 
 
 
316 aa  46.2  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1184  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.98 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01750  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.4 
 
 
342 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.425442 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1095  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.98 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1071  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.98 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000173774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1077  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.98 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0101  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.37 
 
 
307 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1228  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.98 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2744  hypothetical protein  24.74 
 
 
343 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2154  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  36.26 
 
 
343 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.172601  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4721  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.42 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1293  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.67 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1332  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.67 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.985696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3808  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  26.57 
 
 
339 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0104  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  23.53 
 
 
325 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0823  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.78 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0890  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.29 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4114  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.67 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2408  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.38 
 
 
317 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2686  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.06 
 
 
325 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0229  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.84 
 
 
330 aa  43.1  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1255  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.36 
 
 
310 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3112  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  26.39 
 
 
325 aa  42.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0271705  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3799  hypothetical protein  30.77 
 
 
339 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0237  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.18 
 
 
328 aa  42.7  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.524505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>