78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3808 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3808  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  100 
 
 
339 aa  693    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6137  hypothetical protein  30.94 
 
 
363 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295579  normal  0.0515826 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7424  hypothetical protein  31.53 
 
 
363 aa  92.8  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0373604  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0424  hypothetical protein  28.41 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.938992  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0139  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  29.37 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6015  hypothetical protein  30.49 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00375312  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5650  hypothetical protein  30.49 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6506  hypothetical protein  30.49 
 
 
364 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0418  hypothetical protein  28.92 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2889  hypothetical protein  38.33 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0127  hypothetical protein  38.33 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1461  hypothetical protein  38.33 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0706  hypothetical protein  38.33 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0540  hypothetical protein  38.33 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3157  hypothetical protein  38.33 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0133  hypothetical protein  29.82 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0522  hypothetical protein  37.5 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.724316  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4271  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  27.88 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  hitchhiker  0.000248822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3801  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  29.09 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4277  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  27.35 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141779 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1717  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  31.13 
 
 
329 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5272  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  31.28 
 
 
325 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0828  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.1 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3650  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  36.05 
 
 
325 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2265  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.25 
 
 
326 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3727  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0636  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  32.14 
 
 
332 aa  53.9  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2633  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.81 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3280  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.81 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2792  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  31.33 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2907  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  31.33 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.152596  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2912  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.1 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2479  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  31.33 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.91 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.0499855 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2802  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  31.33 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1802  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  31.33 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44344  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0530  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  31.33 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3076  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  35.17 
 
 
325 aa  53.5  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1121  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.91 
 
 
329 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0641  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.91 
 
 
329 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1079  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.91 
 
 
329 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.796482 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1050  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  29.09 
 
 
326 aa  53.1  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.682522  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1389  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  37.24 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1730  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  33.56 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4233  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.96 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0405  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  29.02 
 
 
328 aa  50.4  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2853  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.72 
 
 
329 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431701  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0821  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.17 
 
 
325 aa  50.4  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0516766  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  29.15 
 
 
325 aa  49.7  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2430  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.6 
 
 
326 aa  49.3  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2328  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.94 
 
 
321 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.927154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1748  hypothetical protein  22.74 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1806  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.31 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.278367  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1916  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III, putative  30.36 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0253163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1791  hypothetical protein  23.33 
 
 
331 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00930231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1930  hypothetical protein  23.33 
 
 
331 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.877673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1966  hypothetical protein  23.33 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000549282 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1072  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.54 
 
 
329 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3802  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  26.77 
 
 
316 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0997  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.91 
 
 
329 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1001  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.91 
 
 
329 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0611  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  31.72 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1524  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III, putative  26.77 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.40359  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3995  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.76 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.413867  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0915  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.52 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2015  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.48 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0344  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.08 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0355945  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0980  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  29.87 
 
 
326 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3414  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  30.83 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2878  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III, putative  34.13 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0096  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  34.13 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3957  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  34.13 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184726  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3809  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  26.57 
 
 
326 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3453  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  34.13 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.058375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1666  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  34.13 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510468  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3875  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  34.13 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3097  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  34.13 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107158  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3837  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  34.4 
 
 
346 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2744  hypothetical protein  31.58 
 
 
343 aa  42.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>