24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0418 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0418  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  669    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0133  hypothetical protein  64.42 
 
 
353 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4277  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  43.13 
 
 
346 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141779 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0424  hypothetical protein  31.8 
 
 
344 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.938992  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0139  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  28.3 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4271  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  30.03 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  hitchhiker  0.000248822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3801  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  31.37 
 
 
351 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3808  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  28.92 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7424  hypothetical protein  32.33 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0373604  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6137  hypothetical protein  30.67 
 
 
363 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295579  normal  0.0515826 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0127  hypothetical protein  35.94 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2889  hypothetical protein  35.94 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0540  hypothetical protein  35.94 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1461  hypothetical protein  35.94 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3157  hypothetical protein  35.94 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0706  hypothetical protein  35.94 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0522  hypothetical protein  35.16 
 
 
346 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.724316  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6015  hypothetical protein  30.77 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00375312  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5650  hypothetical protein  30.77 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6506  hypothetical protein  28.89 
 
 
364 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4278  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  31.3 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  hitchhiker  0.00544084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3809  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  29.75 
 
 
326 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0417  hypothetical protein  32.31 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0132  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  32.03 
 
 
308 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>