88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4278 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4278  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  100 
 
 		 309 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  hitchhiker  0.00544084 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0417  hypothetical protein  60.4 
 
 		 308 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0132  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  58.42 
 
 		 308 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3802  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  34.3 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0138  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  32.79 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4272  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  31.19 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351964  hitchhiker  0.000234797 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0423  hypothetical protein  33.8 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6140  hypothetical protein  36.81 
 
 		 329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0927717 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0525  hypothetical protein  36.01 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6503  hypothetical protein  35.16 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57028 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0710  hypothetical protein  36.01 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3809  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  33.66 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0543  hypothetical protein  36.01 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6012  hypothetical protein  34.84 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5647  hypothetical protein  34.84 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210784  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2886  hypothetical protein  35.37 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3160  hypothetical protein  35.37 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0130  hypothetical protein  35.37 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1458  hypothetical protein  35.37 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7421  hypothetical protein  34.85 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.399758  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3882  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.74 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.264087  normal  0.0481664 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0089  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.64 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0484  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  26.67 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3263  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  24.11 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4941  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  23.44 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0104  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  24.54 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3948  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  22.57 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6312  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  25.46 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2940  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.79 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00496148  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3003  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.79 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0164422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3249  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.79 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3251  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.79 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0899313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3018  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.79 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000304714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2959  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.39 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00328418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3556  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  26.94 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.896137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.07 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2017  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  24.47 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2075  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.15 
 
 		 335 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317439  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4151  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.54 
 
 		 331 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.304596 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3231  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.31 
 
 		 348 aa  52.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3995  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.87 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.413867  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0418  hypothetical protein  31.3 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000281489  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0133  hypothetical protein  26.8 
 
 		 353 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2744  hypothetical protein  19.19 
 
 		 343 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.41 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0005  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  24.62 
 
 		 331 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1378  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  24.22 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4277  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  35.29 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1436  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.08 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00250682  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1826  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.73 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.326226  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.53 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.732664 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0235  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  20.31 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000242773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1691  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.73 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1833  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.95 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1523  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.77 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00187738  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3509  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.32 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0074  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.63 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1086  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  29.5 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0031  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.4 
 
 		 336 aa  46.6  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0645987  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0638  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.4 
 
 		 324 aa  46.2  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1949  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.18 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.153488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1914  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.18 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2887  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  20.36 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00165414  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4400  hypothetical protein  29.48 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51410  PqsC  29.48 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000109894 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0604  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.58 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6403  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  24.41 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0821  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.93 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0516766  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.34 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1648  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.18 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000989072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0956  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.76 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0536349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1870  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.91 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24897e-18 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1058  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.4 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0418  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.68 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1672  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.37 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112453  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0237  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.51 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.524505  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0611  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.68 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2750  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  30.25 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2842  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  30.25 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.61653  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1645  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  26.75 
 
 		 346 aa  42.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0863125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51390  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  29.03 
 
 		 337 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1817  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.47 
 
 		 329 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.442816  hitchhiker  0.00257504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1717  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.12 
 
 		 319 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441505  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1714  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.12 
 
 		 319 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000275042  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1757  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.12 
 
 		 319 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2575  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.12 
 
 		 319 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000148386  normal  0.052755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>