42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2886 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2886  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0525  hypothetical protein  99.4 
 
 
332 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1458  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0130  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  673    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0543  hypothetical protein  99.4 
 
 
332 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0710  hypothetical protein  99.4 
 
 
332 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3160  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  673    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6503  hypothetical protein  53.85 
 
 
327 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57028 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5647  hypothetical protein  53.85 
 
 
327 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210784  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6012  hypothetical protein  53.85 
 
 
327 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139074  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7421  hypothetical protein  53.67 
 
 
329 aa  335  7e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.399758  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6140  hypothetical protein  53.23 
 
 
329 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0927717 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0417  hypothetical protein  34.28 
 
 
308 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4278  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  35.37 
 
 
309 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  hitchhiker  0.00544084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0132  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  32.7 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3802  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  30.28 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3809  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  31.69 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0423  hypothetical protein  31.29 
 
 
315 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0138  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  31.9 
 
 
315 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4272  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  30.11 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351964  hitchhiker  0.000234797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0484  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  27.16 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305629  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3263  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  24.44 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5693  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  28.02 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.100391 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0089  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  21.83 
 
 
307 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4233  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.09 
 
 
329 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3414  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  20.36 
 
 
322 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_003296  RS01921  hypothetical protein  25.93 
 
 
308 aa  46.2  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968131  hitchhiker  0.00589558 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1079  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.65 
 
 
329 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.796482 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1121  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.65 
 
 
329 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.23 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.0499855 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0641  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.65 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0133  hypothetical protein  34.25 
 
 
353 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1717  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.68 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6312  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  24.47 
 
 
315 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1058  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.62 
 
 
308 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0104  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  23.72 
 
 
325 aa  42.7  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1802  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.62 
 
 
329 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44344  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2792  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.62 
 
 
329 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2802  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.62 
 
 
329 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2479  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.62 
 
 
329 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2907  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.62 
 
 
329 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.152596  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0530  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.62 
 
 
329 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>