52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01921 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01921  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  636    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968131  hitchhiker  0.00589558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1082  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.93 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.912749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1058  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.59 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4310  hypothetical protein  22.68 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6312  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  25.75 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4215  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  22.93 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3097  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  29.55 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1338  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.88 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3787  hypothetical protein  25.97 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0256847 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5693  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  23.89 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.100391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.37 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3017  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.73 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0433  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  34.27 
 
 		 346 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0463016  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1630  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.68 
 
 		 324 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0350  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.55 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.110992  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51390  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.08 
 
 		 337 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116987 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0373  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.21 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1324  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.47 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.760998  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0023  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.57 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4399  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.49 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1784  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  24.64 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1523  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.1 
 
 		 326 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00187738  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1916  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III, putative  30.07 
 
 		 338 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0253163  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0130  hypothetical protein  25.93 
 
 		 332 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1458  hypothetical protein  25.93 
 
 		 332 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3160  hypothetical protein  25.93 
 
 		 332 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0237  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.52 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.524505  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2886  hypothetical protein  25.93 
 
 		 332 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0459  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  20.27 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3033  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.3 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1136  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.07 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.896107  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0710  hypothetical protein  25.18 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0255  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.21 
 
 		 335 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0543  hypothetical protein  25.18 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0525  hypothetical protein  25.18 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2923  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.78 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.437795  hitchhiker  0.000795877 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2136  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.41 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1492  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.02 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.560119  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1932  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.94 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543004  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5065  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.77 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14100  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.29 
 
 		 334 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1264  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.5 
 
 		 312 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185318 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1112  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.17 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02706  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.46 
 
 		 325 aa  42.7  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3948  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  26.28 
 
 		 314 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2490  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.18 
 
 		 329 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2803  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  29.53 
 
 		 346 aa  42.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2650  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.08 
 
 		 325 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.86 
 
 		 396 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1206  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.17 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0914  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  23.02 
 
 		 323 aa  42.4  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01501  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  23.37 
 
 		 310 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>