35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6140 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6140  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  670    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0927717 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6503  hypothetical protein  93.31 
 
 		 327 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57028 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7421  hypothetical protein  93.31 
 
 		 329 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.399758  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5647  hypothetical protein  93.01 
 
 		 327 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210784  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6012  hypothetical protein  93.01 
 
 		 327 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0710  hypothetical protein  53.55 
 
 		 332 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0543  hypothetical protein  53.55 
 
 		 332 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0525  hypothetical protein  53.55 
 
 		 332 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3160  hypothetical protein  53.23 
 
 		 332 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2886  hypothetical protein  53.23 
 
 		 332 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1458  hypothetical protein  53.23 
 
 		 332 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0130  hypothetical protein  53.23 
 
 		 332 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4278  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  36.81 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  hitchhiker  0.00544084 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0417  hypothetical protein  31.37 
 
 		 308 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0132  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  31.29 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3809  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  30.96 
 
 		 326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3802  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  28.11 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4272  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  30.58 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351964  hitchhiker  0.000234797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0138  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.64 
 
 		 315 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0423  hypothetical protein  30.36 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3414  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.65 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3263  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.49 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0484  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  23.11 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0089  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  23.02 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0235  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  21.37 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000242773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2792  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.55 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1802  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.43 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44344  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2853  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.55 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431701  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0530  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.43 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2802  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.43 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2479  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.43 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2907  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.55 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.152596  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0823  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.34 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0104  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  21.88 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3882  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  24.14 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.264087  normal  0.0481664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>