36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5647 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6503  hypothetical protein  99.39 
 
 
327 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57028 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5647  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210784  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6012  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139074  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7421  hypothetical protein  94.22 
 
 
329 aa  632  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.399758  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6140  hypothetical protein  93.01 
 
 
329 aa  627  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0927717 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0710  hypothetical protein  54.17 
 
 
332 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0543  hypothetical protein  54.17 
 
 
332 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0525  hypothetical protein  54.17 
 
 
332 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3160  hypothetical protein  53.85 
 
 
332 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2886  hypothetical protein  53.85 
 
 
332 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1458  hypothetical protein  53.85 
 
 
332 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0130  hypothetical protein  53.85 
 
 
332 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4278  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  34.84 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  hitchhiker  0.00544084 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0417  hypothetical protein  31.7 
 
 
308 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0132  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  31.37 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3809  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  32.53 
 
 
326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3802  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  30.25 
 
 
316 aa  126  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4272  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  31.18 
 
 
311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351964  hitchhiker  0.000234797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0138  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  30 
 
 
315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0423  hypothetical protein  30.36 
 
 
315 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3414  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  23.56 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0484  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  26.96 
 
 
310 aa  59.7  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305629  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3263  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.49 
 
 
311 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0089  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  23.02 
 
 
307 aa  54.3  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0104  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  23.28 
 
 
325 aa  49.3  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3882  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  24.89 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.264087  normal  0.0481664 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05699  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.64 
 
 
365 aa  46.2  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0235  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  20.97 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000242773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2479  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.48 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0530  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.48 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1802  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.48 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44344  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2802  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.48 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2907  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.48 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.152596  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2853  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.48 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431701  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2792  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.48 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000084  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III protein 2  23.08 
 
 
364 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>