55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0423 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0423  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0138  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  83.81 
 
 		 315 aa  541  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4272  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  64.94 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351964  hitchhiker  0.000234797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3802  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  50.16 
 
 		 316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0417  hypothetical protein  30.92 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4278  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  33.8 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  hitchhiker  0.00544084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0132  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  30.64 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0543  hypothetical protein  31.65 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0710  hypothetical protein  31.65 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0525  hypothetical protein  31.65 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2886  hypothetical protein  31.29 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1458  hypothetical protein  31.29 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0130  hypothetical protein  31.29 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3160  hypothetical protein  31.29 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6140  hypothetical protein  30.36 
 
 		 329 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0927717 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5647  hypothetical protein  30.36 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210784  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6012  hypothetical protein  30.36 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7421  hypothetical protein  30.71 
 
 		 329 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.399758  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6503  hypothetical protein  30.36 
 
 		 327 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0484  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  31.86 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3809  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  27.55 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0104  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  27.13 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3882  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  28.7 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.264087  normal  0.0481664 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0089  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.41 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3263  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  28.37 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0101  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  26.03 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3097  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  26.92 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.04 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1932  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.66 
 
 		 332 aa  52.8  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543004  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0748  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.66 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2037  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.66 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0309  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  26.97 
 
 		 323 aa  50.4  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0542748  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1601  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.95 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3231  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.99 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2940  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.87 
 
 		 329 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00496148  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0656  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.32 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1523  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.1 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00187738  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0823  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.79 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0115  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III domain-containing protein  22.42 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0821  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.81 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0516766  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5065  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.32 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1748  hypothetical protein  23.05 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  24.23 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262189  normal  0.437355 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5766  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.92 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5526  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.65 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.386832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0933  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.9 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1154  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.46 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3414  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  20.07 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2109  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  23.11 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2329  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  30.59 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0422  beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  25.52 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.29 
 
 		 339 aa  42.7  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.707185  normal  0.207521 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1601  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.42 
 
 		 325 aa  42.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.995232  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4233  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.61 
 
 		 329 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2054  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  30 
 
 		 326 aa  42.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.328205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>