76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4721 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4721  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  100 
 
 		 346 aa  693    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2030  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  46.82 
 
 		 343 aa  288  7e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3614  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  40.8 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.869023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1229  putative 3-oxoacyl-ACP synthase III  35.31 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2784  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  32.95 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000374378  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4851  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  30.77 
 
 		 347 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2095  putative 3-oxoacyl-ACP synthase III  27.14 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9238  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.27 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0823  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.05 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1850  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.56 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0518  hypothetical protein  21.39 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.397624  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07545  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  22.65 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2154  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  25.96 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.172601  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1072  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.44 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2731  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  23.12 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1079  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.2 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796482 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1154  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.31 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000934298  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1121  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.2 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0641  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.8 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4233  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.86 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3017  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.12 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1671  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain-containing protein  24.72 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.169352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.66 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.0499855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.48 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0459  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  21.84 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0422  beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  23.76 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0484  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  37.88 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5065  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.58 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3556  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  24.41 
 
 		 319 aa  53.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.896137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0223  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.06 
 
 		 348 aa  52.8  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.583463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2328  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.79 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.927154  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0104  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  27.75 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3033  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  31.03 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1601  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.74 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0233634  normal  0.552006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.25 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1717  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.66 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1136  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  20.41 
 
 		 324 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.896107  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1072  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.43 
 
 		 329 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0636  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.78 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1916  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III, putative  25.99 
 
 		 338 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0253163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0255  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  20.35 
 
 		 335 aa  49.7  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000084  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III protein 2  21.65 
 
 		 364 aa  49.7  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61467  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.65 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.732664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2912  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.85 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2505  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.85 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000055762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0828  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2750  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  24.71 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2842  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.71 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.61653  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2744  hypothetical protein  19.21 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0997  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.86 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1001  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.86 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1414  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.31 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.662472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2265  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.9 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3727  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1324  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  20.63 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.760998  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05699  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.69 
 
 		 365 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0749  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.49 
 
 		 310 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000257819  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2430  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.93 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.81 
 
 		 333 aa  46.2  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1585  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.51 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2003  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.29 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0985  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.41 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3809  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  25.42 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2015  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.24 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10260  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.32 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00789963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3799  hypothetical protein  22.06 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0068  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.73 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2329  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.65 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1645  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.61 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2803  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.86 
 
 		 346 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0005  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  25.14 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1605  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.32 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.23 
 
 		 331 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3414  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  20.21 
 
 		 322 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1911  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.83 
 
 		 322 aa  42.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2054  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.07 
 
 		 326 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.328205 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.23 
 
 		 331 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>