38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4851 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4851  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  100 
 
 		 347 aa  694    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2095  putative 3-oxoacyl-ACP synthase III  45.54 
 
 		 346 aa  248  9e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1229  putative 3-oxoacyl-ACP synthase III  36.42 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2784  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  38.16 
 
 		 342 aa  175  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000374378  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4721  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  30.77 
 
 		 346 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3614  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  30.48 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.869023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2030  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  29.26 
 
 		 343 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0422  beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  23.8 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1530  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.3 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2744  hypothetical protein  20.66 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9238  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.06 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0744  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.92 
 
 		 328 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.968089  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1850  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.25 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1671  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain-containing protein  25.28 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.169352 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0138  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.77 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0567  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.18 
 
 		 339 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.140708  normal  0.209954 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1136  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.47 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.896107  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1853  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  31.65 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1645  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.34 
 
 		 344 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01531  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.47 
 
 		 335 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.163263  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3799  hypothetical protein  26.16 
 
 		 339 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01551  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30 
 
 		 335 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01501  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  31.4 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0229  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.56 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0405  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  33.07 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1324  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  20.73 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.760998  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1966  hypothetical protein  21.3 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000549282 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1930  hypothetical protein  21.3 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.877673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1791  hypothetical protein  21.3 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00930231  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2386  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  33.09 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0713  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.56 
 
 		 331 aa  44.3  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.36705 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2531  hypothetical protein  23.33 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  0.405407 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0518  hypothetical protein  20.68 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.397624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2015  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  34.13 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1748  hypothetical protein  21.01 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0914  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  32.26 
 
 		 323 aa  43.5  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0574  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  30.65 
 
 		 319 aa  43.1  0.008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.383366  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5765  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  30.77 
 
 		 371 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>