482 genes were found for organism Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 5    << first  < prev  1  2  3  4  5    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Mnod_7772  CDS  NC_011887  37  2001  +  1965  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  YP_002489978  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7773  CDS  NC_011887  1998  3122  +  1125  monooxygenase FAD-binding  YP_002489979  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7774  CDS  NC_011887  3122  4210  +  1089  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_002489980  normal  0.722552  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7775  CDS  NC_011887  4207  4665  +  459  thioesterase superfamily protein  YP_002489981  normal  0.327682  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7776  CDS  NC_011887  4956  5936  +  981  transposase IS111A/IS1328/IS1533  YP_002489982  normal  0.99895  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7777  CDS  NC_011887  6128  7060  -  933  transcriptional regulator, LysR family  YP_002489983  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7778  CDS  NC_011887  7278  7925  +  648  DSBA oxidoreductase  YP_002489984  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7779    NC_011887  8033  8221  -  189      normal  0.494172  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7780    NC_011887  8493  9125  +  633      normal  0.486726  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7781  CDS  NC_011887  9409  10266  +  858  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002489985  normal  0.398474  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7782  CDS  NC_011887  10379  11383  -  1005  aminoglycoside phosphotransferase  YP_002489986  normal  0.165999  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7783  CDS  NC_011887  11380  12660  -  1281  enolase  YP_002489987  normal  0.263643  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7784  CDS  NC_011887  13635  14294  +  660  transcriptional activator, TenA family  YP_002489988  normal  0.0242507  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7785  CDS  NC_011887  14524  14658  -  135  integrase catalytic region  YP_002489989  hitchhiker  0.00395813  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7786  CDS  NC_011887  14674  14997  -  324  hypothetical protein  YP_002489990  decreased coverage  0.0016591  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7787  CDS  NC_011887  15055  15381  -  327  transposase IS3/IS911 family protein  YP_002489991  decreased coverage  0.00188003  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7788  CDS  NC_011887  15481  16524  -  1044  plasmid partitioning protein RepB  YP_002489992  normal  0.256779  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7789  CDS  NC_011887  16521  17738  -  1218  plasmid partitioning protein RepA  YP_002489993  normal  0.45198  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7790    NC_011887  18245  18373  +  129      normal  0.528405  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7791  CDS  NC_011887  18479  19450  +  972  Integrase catalytic region  YP_002489994  normal  0.562755  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7792  CDS  NC_011887  19541  20875  -  1335  transposase IS4 family protein  YP_002489995  normal  0.275885  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7793    NC_011887  21088  21408  -  321      normal  0.830841  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7794  CDS  NC_011887  21390  22115  -  726  transposase IS4 family protein  YP_002489996  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7795    NC_011887  22207  22473  -  267      normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7796  CDS  NC_011887  22479  22688  +  210  hypothetical protein  YP_002489997  normal  0.809055  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7797  CDS  NC_011887  22867  24117  -  1251  hypothetical protein  YP_002489998  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7798  CDS  NC_011887  24962  26095  +  1134  hypothetical protein  YP_002489999  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7799    NC_011887  26479  28085  -  1607      normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7800  CDS  NC_011887  28902  29807  -  906  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  YP_002490000  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7801  CDS  NC_011887  30107  30922  -  816  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  YP_002490001  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7802  CDS  NC_011887  31016  32854  -  1839  thiamine pyrophosphate protein central region  YP_002490002  normal  0.821593  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7803  CDS  NC_011887  32851  34773  -  1923  PfkB domain protein  YP_002490003  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7804  CDS  NC_011887  34804  35703  -  900  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  YP_002490004  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7805  CDS  NC_011887  35816  36739  -  924  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  YP_002490005  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7806  CDS  NC_011887  36821  37606  -  786  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  YP_002490006  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7807  CDS  NC_011887  37616  38626  -  1011  oxidoreductase domain protein  YP_002490007  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7808  CDS  NC_011887  38742  39776  -  1035  inner-membrane translocator  YP_002490008  normal  0.695038  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7809  CDS  NC_011887  39802  41340  -  1539  ABC transporter related  YP_002490009  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7810  CDS  NC_011887  41423  42364  -  942  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  YP_002490010  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7811  CDS  NC_011887  42753  43781  -  1029  transcriptional regulator, LacI family  YP_002490011  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7812  CDS  NC_011887  44173  45126  +  954  transcriptional regulator, LysR family  YP_002490012  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7813  CDS  NC_011887  45385  46632  -  1248  allantoate amidohydrolase  YP_002490013  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7814  CDS  NC_011887  46944  47990  +  1047  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  YP_002490014  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7815  CDS  NC_011887  47993  49321  +  1329  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002490015  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7816  CDS  NC_011887  49353  49994  +  642  Dimethylmenaquinone methyltransferase  YP_002490016  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7817  CDS  NC_011887  49991  50380  +  390  Endoribonuclease L-PSP  YP_002490017  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7818    NC_011887  50679  51237  +  559      normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7819  CDS  NC_011887  51620  52456  +  837  hypothetical protein  YP_002490018  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7820  CDS  NC_011887  52453  52944  +  492  ureidoglycolate hydrolase  YP_002490019  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7821    NC_011887  52932  53144  +  213      normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7822    NC_011887  53147  53335  -  189      normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7823  CDS  NC_011887  53532  54347  +  816  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  YP_002490020  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7824  CDS  NC_011887  54726  54974  +  249  hypothetical protein  YP_002490021  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7825  CDS  NC_011887  55099  55377  -  279  hypothetical protein  YP_002490022  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7826  CDS  NC_011887  55794  56318  -  525  transcriptional regulator, MucR family  YP_002490023  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7827    NC_011887  56692  57126  +  435      normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7828  CDS  NC_011887  57305  57445  -  141  hypothetical protein  YP_002490024  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7829  CDS  NC_011887  59063  59350  +  288  chaperonin Cpn10  YP_002490025  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7830  CDS  NC_011887  59442  61091  +  1650  chaperonin GroEL  YP_002490026  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7831  CDS  NC_011887  61785  61949  +  165  hypothetical protein  YP_002490027  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7832  CDS  NC_011887  62164  62364  +  201  hypothetical protein  YP_002490028  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7833  CDS  NC_011887  62762  64960  +  2199  glycosyl transferase group 1  YP_002490029  normal  0.850613  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7834  CDS  NC_011887  64957  65907  +  951  Methyltransferase type 11  YP_002490030  normal  0.26678  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7835  CDS  NC_011887  65904  67271  +  1368  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_002490031  normal  0.0325123  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7836  CDS  NC_011887  67309  68130  +  822  LmbE family protein  YP_002490032  normal  0.224776  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7837  CDS  NC_011887  68159  68278  +  120  hypothetical protein  YP_002490033  normal  0.455266  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7838  CDS  NC_011887  68746  68919  -  174  hypothetical protein  YP_002490034  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7839  CDS  NC_011887  68939  69262  -  324  hypothetical protein  YP_002490035  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7840  CDS  NC_011887  69535  69789  +  255  hypothetical protein  YP_002490036  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7841  CDS  NC_011887  70108  71745  +  1638  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  YP_002490037  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7842  CDS  NC_011887  71860  72309  -  450  transcriptional regulator, MerR family  YP_002490038  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7843  CDS  NC_011887  72364  74871  -  2508  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_002490039  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7844  CDS  NC_011887  75047  75748  +  702  putative transposase  YP_002490040  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7845  CDS  NC_011887  76023  76886  -  864  porin  YP_002490041  normal  0.190915  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7846  CDS  NC_011887  78182  78886  -  705  putative insertion sequence transposase-like protein  YP_002490042  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7847    NC_011887  79184  79372  -  189      normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7848  CDS  NC_011887  79436  80137  +  702  putative transposase  YP_002490043  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7849    NC_011887  80175  80351  -  177      normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7850  CDS  NC_011887  80494  81264  -  771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002490044  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7851  CDS  NC_011887  81386  81883  +  498  transcriptional regulator, TetR family  YP_002490045  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7852  CDS  NC_011887  82602  83336  -  735  hypothetical protein  YP_002490046  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7853  CDS  NC_011887  83329  85683  -  2355  molybdopterin oxidoreductase  YP_002490047  normal  0.710352  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7854  CDS  NC_011887  85807  87045  -  1239  aminotransferase class I and II  YP_002490048  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7855  CDS  NC_011887  87313  88503  -  1191  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  YP_002490049  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7856  CDS  NC_011887  88618  89952  -  1335  transposase IS4 family protein  YP_002490050  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7857  CDS  NC_011887  90143  90928  -  786  ABC transporter related  YP_002490051  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7858  CDS  NC_011887  90940  92124  -  1185  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_002490052  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7859  CDS  NC_011887  92128  93339  -  1212  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_002490053  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7860  CDS  NC_011887  93464  94489  -  1026  extracellular solute-binding protein family 3  YP_002490054  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7861  CDS  NC_011887  95156  95977  -  822  transcriptional regulator, AraC family  YP_002490055  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7862  CDS  NC_011887  96123  97355  -  1233  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002490056  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7863  CDS  NC_011887  97364  98683  -  1320  tetratricopeptide TPR_4  YP_002490057  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7864  CDS  NC_011887  98864  99091  +  228  hypothetical protein  YP_002490058  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7865  CDS  NC_011887  98977  99357  -  381  transposase IS3/IS911 family protein  YP_002490059  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7866  CDS  NC_011887  99433  100380  +  948  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_002490060  normal  0.848631  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7867  CDS  NC_011887  100565  101368  +  804  transcriptional regulator, AraC family  YP_002490061  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7868    NC_011887  101424  101656  -  233      normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7869    NC_011887  101676  101906  -  231      normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7870  CDS  NC_011887  101969  102670  +  702  putative transposase  YP_002490062  normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_7871    NC_011887  102827  103069  +  243      normal  1  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 5    << first  < prev  1  2  3  4  5    next >  last >>