25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7827 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_7827    100 
 
 
435 bp  862    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.31 
 
 
1053 bp  89.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.31 
 
 
1053 bp  89.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.31 
 
 
1053 bp  89.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.31 
 
 
1053 bp  89.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.31 
 
 
1053 bp  89.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1574  transposase IS116/IS110/IS902  86.36 
 
 
1041 bp  79.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4622  transposase IS116/IS110/IS902  86.36 
 
 
1041 bp  79.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4440  transposase IS116/IS110/IS902  86.36 
 
 
1041 bp  79.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3642  transposase IS116/IS110/IS902  86.36 
 
 
1041 bp  79.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404408  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3275  transposase IS116/IS110/IS902  86.36 
 
 
1041 bp  79.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145129  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3160  transposase IS116/IS110/IS902  86.36 
 
 
1041 bp  79.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0233772  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3124  transposase IS116/IS110/IS902  86.36 
 
 
1041 bp  79.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2092  transposase IS116/IS110/IS902  86.36 
 
 
1041 bp  79.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2061  transposase IS116/IS110/IS902  86.36 
 
 
1041 bp  79.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.232183  normal  0.150463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2010  transposase IS116/IS110/IS902  86.36 
 
 
1041 bp  79.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.657114  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1966  transposase IS116/IS110/IS902  86.36 
 
 
1041 bp  79.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0965  transposase IS116/IS110/IS902  86.36 
 
 
1041 bp  79.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  89.13 
 
 
1029 bp  52  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5032  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  91.67 
 
 
1017 bp  48.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0345  transposase IS116/IS110/IS902  91.43 
 
 
1032 bp  46.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.211948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1921  transposase IS116/IS110/IS902  91.43 
 
 
1032 bp  46.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876079  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2447  transposase IS116/IS110/IS902  91.43 
 
 
1032 bp  46.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3074  transposase IS116/IS110/IS902  91.43 
 
 
1032 bp  46.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3076  transposase IS116/IS110/IS902  91.43 
 
 
1032 bp  46.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>