28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0030 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006365  plpp0030  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4436  type-F conjugative transfer system protein TraW  37.19 
 
 		 234 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4380  type-F conjugative transfer system protein TraW  37.19 
 
 		 234 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4625  type-F conjugative transfer system protein TraW  37.19 
 
 		 234 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.992318 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4533  type-F conjugative transfer system protein TraW  37.19 
 
 		 234 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.8295 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4440  Type-F conjugative transfer system protein TraW  37.69 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4292  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  37.11 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4504  type-F conjugative transfer system protein TraW  38 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5375  Type-F conjugative transfer system protein TraW  33.16 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.670393 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0022  hypothetical protein  34.36 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_10  conjugative transfer protein TraW  36.41 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.760813  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2166  hypothetical protein  32.65 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0027  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  33.51 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4175  hypothetical protein  32.86 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0943876 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0348  sex pilus assembly protein  31.86 
 
 		 230 aa  104  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6168  type-F conjugative transfer system protein TraW  29.81 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00281351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2324  hypothetical protein  34.43 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1531  membrane lipoprotein lipid attachment site  32.63 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337431  normal  0.871932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2657  hypothetical protein  35.15 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4230  hypothetical protein  27.5 
 
 		 212 aa  97.8  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6804  hypothetical protein  29.44 
 
 		 213 aa  91.3  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0250  hypothetical protein  27.08 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0313  conserved hypothetical cytosolic protein  23.65 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6263  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3774  hypothetical protein  27.59 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4208  hypothetical protein  24.62 
 
 		 431 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000759939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0098  type IV conjugative transfer system protein TraW  24.02 
 
 		 421 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.122831 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0973  putative cytoplasmic protein  23.67 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.545358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>