More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1997 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  541  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  93.89 
 
 		 262 aa  488  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.04 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.42 
 
 		 275 aa  195  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.68 
 
 		 272 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.74 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 		 272 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.48 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.11 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 		 277 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.71 
 
 		 282 aa  174  9e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.33 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.92 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.92 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2683  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000101037  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.67 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1331  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.74 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.2 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.74 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.79 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2861  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.74 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0351901  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.63 
 
 		 270 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.15 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.74 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.41 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.15 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.67 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.5 
 
 		 272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 		 272 aa  164  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1231  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.27 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000109487  normal  0.438718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.83 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.12 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.7 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.27 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.01 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1192  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.12 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000775485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1263  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.12 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00228679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2500  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.88 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000695337  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0761  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.36 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.66 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  36.09 
 
 		 278 aa  162  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.36 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.73 
 
 		 270 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.73 
 
 		 270 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.73 
 
 		 270 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.73 
 
 		 270 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.73 
 
 		 270 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.73 
 
 		 270 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.74 
 
 		 274 aa  161  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.73 
 
 		 270 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.47 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.96 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.09 
 
 		 280 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.41 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2357  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.83 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.64 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3016  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.7 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.41 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.41 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 		 285 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1126  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 		 272 aa  158  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000450771  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.47 
 
 		 271 aa  158  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.66 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 		 276 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.47 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.35 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.12 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.69 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.5 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.09 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.04 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.93 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.82 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>