85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2164 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2164  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  259  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2191  hypothetical protein  96.09 
 
 
128 aa  254  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  58.2 
 
 
127 aa  152  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  57.38 
 
 
127 aa  151  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3708  hypothetical protein  59.84 
 
 
127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3269  hypothetical protein  57.38 
 
 
127 aa  149  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3728  hypothetical protein  56.45 
 
 
127 aa  148  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0800584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  53.54 
 
 
127 aa  148  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0849  hypothetical protein  57.38 
 
 
127 aa  147  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  57.38 
 
 
127 aa  148  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3173  hypothetical protein  56.56 
 
 
127 aa  147  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  56.56 
 
 
127 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  57.38 
 
 
127 aa  147  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  56.56 
 
 
127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1010  hypothetical protein  55.74 
 
 
127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1022  hypothetical protein  55.74 
 
 
127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.833543  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0720  hypothetical protein  61.4 
 
 
128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  55.47 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0936  hypothetical protein  58.1 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000828174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  49.12 
 
 
133 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  45.9 
 
 
123 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2496  membrane protein-like protein  48.65 
 
 
130 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.040419  normal  0.199912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1964  membrane protein-like  43.44 
 
 
123 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3444  membrane protein-like protein  43.44 
 
 
123 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.579203  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0756  hypothetical protein  48.28 
 
 
129 aa  100  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  41.8 
 
 
123 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4079  membrane protein-like protein  42.62 
 
 
123 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3977  membrane protein-like protein  41.8 
 
 
123 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109107  normal  0.438253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4287  membrane protein-like  42.62 
 
 
123 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  39.67 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1928  transmembrane protein  36.97 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0661  hypothetical protein  37.5 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850631  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0752  hypothetical protein  37.5 
 
 
243 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2042  hypothetical protein  37.5 
 
 
243 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  40 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0734  putative transmembrane protein  40.52 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106149  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07020  hypothetical protein  40.18 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  39.32 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0804  hypothetical protein  39.66 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  36.21 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.784909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  39.64 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  37.7 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0294  membrane protein-like protein  38.98 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  39.29 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0321  membrane protein-like protein  39.83 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0441228  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  36.89 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  34.15 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0450  membrane protein-like protein  37.84 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  36.07 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  35.77 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1826  hypothetical protein  36.59 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1852  hypothetical protein  36.59 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2744  hypothetical protein  34.91 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.200077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4798  hypothetical protein  34.71 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0380  hypothetical protein  34.71 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2647  hypothetical protein  34.86 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00167697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2271  membrane protein-like  33.06 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  33.93 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2325  membrane protein-like protein  36.67 
 
 
141 aa  60.1  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.540964 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1132  hypothetical protein  30.56 
 
 
126 aa  58.9  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202391  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0927  hypothetical protein  32.5 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0816  hypothetical protein  34.71 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0838282 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3416  hypothetical protein  34.17 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0831  transmembrane protein  33.06 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  35.09 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02203  hypothetical protein  29.13 
 
 
128 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  27.84 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2308  hypothetical protein  31.71 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.868044 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2005  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1510  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4900  membrane protein-like protein  36.36 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11061  hypothetical protein  31.86 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  29.17 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2347  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0464  hypothetical protein  31 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11791  hypothetical protein  31 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.469395  normal  0.0438894 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1027  hypothetical protein  30.97 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00407266  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11071  hypothetical protein  30.97 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2531  hypothetical protein  37.23 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247104  normal  0.592717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  28.44 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3506  inner membrane protein  28.89 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.701287  normal  0.583809 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  28.57 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  27.78 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11021  hypothetical protein  30 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  27.78 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>