24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0089 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0089  putative phage tail tape measure protein  100 
 
 		 1521 aa  3075    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1388  hypothetical protein  28.16 
 
 		 346 aa  94.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2697  hypothetical protein  28.92 
 
 		 553 aa  86.7  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3355  putative tape measure protein  28.57 
 
 		 775 aa  80.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0680  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1308 aa  69.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3444  phage tape measure protein  28.24 
 
 		 904 aa  68.6  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2103  phage tape measure protein  26.82 
 
 		 1307 aa  68.6  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.56214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2149  phage tape measure protein  26.44 
 
 		 1308 aa  65.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.843593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1684  phage tape measure protein  23.7 
 
 		 1292 aa  63.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3289  phage tape measure protein  29.94 
 
 		 838 aa  59.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.4409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5328  phage tape measure protein  29.76 
 
 		 837 aa  59.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227887  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  35.23 
 
 		 1031 aa  56.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  35.23 
 
 		 1031 aa  56.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1404  hypothetical protein  39.77 
 
 		 710 aa  55.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  34.09 
 
 		 1028 aa  54.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  34.09 
 
 		 1028 aa  54.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  36.36 
 
 		 1028 aa  53.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  38.1 
 
 		 760 aa  52  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2689  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1056 aa  50.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1643  phage tape measure protein  28.4 
 
 		 938 aa  51.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  42.62 
 
 		 1122 aa  49.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3387  hypothetical protein  22.15 
 
 		 715 aa  47.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000202252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  44.23 
 
 		 914 aa  47.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  27.02 
 
 		 970 aa  47.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>