25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1604 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  39.66 
 
 		 1061 aa  733    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2680  coagulation factor 5/8 type domain protein  59.47 
 
 		 1055 aa  1301    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.434706  normal  0.896202 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00883  discoidin domain protein  69.56 
 
 		 1044 aa  1499    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0432744  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1547  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  97.81 
 
 		 1050 aa  2083    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425239  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1604  hypothetical protein  100 
 
 		 1050 aa  2150    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.593088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.44 
 
 		 1038 aa  337  5.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1988  hypothetical protein  24.22 
 
 		 725 aa  105  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0789  hypothetical protein  26.85 
 
 		 765 aa  89.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2127  hypothetical protein  22.76 
 
 		 752 aa  85.1  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.655892 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1186  hypothetical protein  23.9 
 
 		 757 aa  73.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.19 
 
 		 695 aa  58.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2197  hypothetical protein  22.06 
 
 		 1083 aa  58.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.322196 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  23.35 
 
 		 627 aa  51.6  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  32.84 
 
 		 433 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  30.53 
 
 		 722 aa  48.1  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  33.02 
 
 		 1028 aa  46.6  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4540  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.89 
 
 		 616 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  20.77 
 
 		 642 aa  47  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  26.39 
 
 		 621 aa  46.2  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.32 
 
 		 1109 aa  45.8  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.07 
 
 		 929 aa  45.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.84 
 
 		 953 aa  45.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  30.1 
 
 		 392 aa  45.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  30.43 
 
 		 1135 aa  44.7  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  25.41 
 
 		 1070 aa  45.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>