35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2802 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2802  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 
677 aa  1372    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461879  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  49.61 
 
 
763 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2698  glycoside hydrolase family 5  42.75 
 
 
390 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1591  carbohydrate binding module 27  39.3 
 
 
669 aa  291  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00319954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1542  carbohydrate binding module 27  38.54 
 
 
667 aa  288  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000596448  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4673  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.81 
 
 
406 aa  234  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06427  Endo-beta-1,4-mannanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ53]  41.1 
 
 
399 aa  218  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293049  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  37.73 
 
 
1050 aa  212  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07639  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  32.7 
 
 
381 aa  177  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.307067 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03358  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT7]  32.99 
 
 
383 aa  177  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725351  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6731  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  33.51 
 
 
394 aa  169  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09276  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  33.23 
 
 
381 aa  167  8e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6857  glycoside hydrolase family 5  31.2 
 
 
383 aa  158  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03297  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT9]  29.85 
 
 
409 aa  157  7e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0788687 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3863  predicted protein  30.14 
 
 
351 aa  154  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4201  putative glycosyl hydrolase  31.94 
 
 
378 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42201  predicted protein  32.98 
 
 
321 aa  124  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0509  mannanase, putative  27.16 
 
 
457 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0374435  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1040  mannanase, putative  28.94 
 
 
440 aa  115  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4036  predicted protein  29.19 
 
 
263 aa  105  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4958  endo-beta-mannanase-like protein  26.51 
 
 
429 aa  88.6  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.777337  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02709  beta-1,4-endoglucanase (Eurofung)  37.24 
 
 
313 aa  84  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0545724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 
9867 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  38.79 
 
 
690 aa  71.2  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1121  hypothetical protein  27.55 
 
 
523 aa  70.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.258088  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  41.03 
 
 
2816 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0936  hypothetical protein  29.28 
 
 
600 aa  49.7  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0138  hypothetical protein  23.5 
 
 
749 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  34.62 
 
 
2839 aa  49.7  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  29.25 
 
 
16322 aa  49.3  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0531  hypothetical protein  29.81 
 
 
1032 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 
4978 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  33.59 
 
 
4748 aa  45.8  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  36 
 
 
3474 aa  44.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3225  glycoside hydrolase family protein  23.15 
 
 
566 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.700942  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>