28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0031 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  100 
 
 
396 aa  789    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  45.36 
 
 
396 aa  323  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  44.81 
 
 
397 aa  315  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  44.05 
 
 
395 aa  296  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  39.28 
 
 
391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  40.2 
 
 
400 aa  250  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  36.5 
 
 
393 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  36.64 
 
 
397 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  37.97 
 
 
407 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4542  hypothetical protein  36.52 
 
 
412 aa  239  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.930892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5052  hypothetical protein  36.76 
 
 
412 aa  235  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  33.49 
 
 
427 aa  208  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4863  hypothetical protein  49.5 
 
 
204 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  47.16 
 
 
199 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2291  hypothetical protein  30.9 
 
 
449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0571  ATPase  27.59 
 
 
461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4293  hypothetical protein  29.9 
 
 
457 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  25.26 
 
 
368 aa  99.8  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06140  hypothetical protein  25.2 
 
 
412 aa  86.3  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20400  hypothetical protein  25.06 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05970  hypothetical protein  27.14 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25650  hypothetical protein  29.6 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13070  hypothetical protein  26.15 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20645  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0503  hypothetical protein  21.17 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02770  ATPase  22.48 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4896  hypothetical protein  26.52 
 
 
441 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.815839 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.1 
 
 
1868 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  24.56 
 
 
1289 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>