25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4809 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4809  RepB plasmid partition  100 
 
 		 297 aa  593  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.32089 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3503  RepB plasmid partition  45.83 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3814  hypothetical protein  45.49 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1190  ParB-like nuclease  48.19 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.411537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0187  ParB-like nuclease  48.19 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0026  RepB plasmid partition  47.55 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2984  hypothetical protein  45.14 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.601531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3174  RepB plasmid partition  42.86 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0032  hypothetical protein  45.74 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0528  RepB plasmid partition  41.3 
 
 		 319 aa  215  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1404  RepB plasmid partition  39.27 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0832  RepB plasmid partition  35.66 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.907486  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2890  RepB plasmid partition  31.34 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.221947  normal  0.683835 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2908  repB plasmid partitioning protein  30.51 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02476  hypothetical protein  29.83 
 
 		 298 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02512  conserved hypothetical protein  29.83 
 
 		 298 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.978931  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0772  RepB plasmid partitioning protein  30.72 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1162  ParB-like nuclease domain-containing protein  28.95 
 
 		 542 aa  49.3  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4750  plasmid partitioning protein  32.26 
 
 		 597 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3173  parB-like partition protein  33.85 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4317  plasmid partitioning protein  30.65 
 
 		 579 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9553  plasmid partitioning protein  33.06 
 
 		 596 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9165  plasmid partitioning protein  30.65 
 
 		 612 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4659  plasmid partitioning protein  31.36 
 
 		 557 aa  42.7  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0021  ParB family protein  33.93 
 
 		 320 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>