31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3618 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3618  MT-A70 family protein  100 
 
 
194 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.92147  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4092  MT-A70 family protein  46.88 
 
 
193 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1679  MT-A70  45.7 
 
 
190 aa  150  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2489  MT-A70 family protein  44.27 
 
 
188 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0901291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3839  MT-A70 family protein  44.79 
 
 
187 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5079  MT-A70 family protein  43.75 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2112  MT-A70 family protein  40.5 
 
 
201 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193598  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1288  MT-A70 family protein  40.5 
 
 
201 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0660  MT-A70 family protein  44.69 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0443  MT-A70 family protein  41.86 
 
 
426 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516252  hitchhiker  0.000000000100538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2710  MT-A70 family protein  39.49 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2137  MT-A70 family protein  36.52 
 
 
224 aa  98.2  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1667  MT-A70 family protein  39.53 
 
 
507 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.584736  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3884  MT-A70 family protein  34.21 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0426  MT-A70 family protein  34.07 
 
 
229 aa  95.1  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2608  MT-A70  35.36 
 
 
226 aa  95.1  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1165  MT-A70 family protein  34.46 
 
 
305 aa  94.7  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  35.36 
 
 
401 aa  93.6  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2318  MT-A70 family protein  37.29 
 
 
435 aa  92  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0246  adenine-specific DNA methyltransferase  34.05 
 
 
216 aa  91.7  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.298743  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2063  MT-A70 family protein  35.96 
 
 
211 aa  88.2  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.524395  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1616  MT-A70 family protein  33.67 
 
 
208 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4628  MT-A70 family protein  35.67 
 
 
186 aa  88.2  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000658429  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3316  hypothetical protein  38.81 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1143  adenine methylase  33.7 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0265355  hitchhiker  1.9630399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3576  adenine methylase  32.39 
 
 
208 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000695706 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0620  MT-A70  28.43 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43977  predicted protein  25.95 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0538105  normal  0.400079 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57562  activator of IME1 Predicted N6-adenine RNA methylase IME4  26.44 
 
 
531 aa  57.4  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03860  mRNA methyltransferase, putative  27.05 
 
 
406 aa  57.8  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1554  hypothetical protein  25.96 
 
 
750 aa  42.4  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>