More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3234 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3234  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 577 aa  1115    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1664  xanthine/uracil permease family protein  33.22 
 
 		 580 aa  223  9e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.139365  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0864  xanthine/uracil permease-like protein  29.5 
 
 		 566 aa  210  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1399  Xanthine/uracil/vitamin C permease  30.95 
 
 		 450 aa  187  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106582 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0106  Xanthine/uracil/vitamin C permease  30.24 
 
 		 450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2628  xanthine/uracil/vitamin C permease  30.7 
 
 		 598 aa  178  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0182  aminoacyl-tRNA synthetase, class Ia  30.58 
 
 		 529 aa  167  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0466  Xanthine/uracil/vitamin C permease  29.26 
 
 		 549 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304923  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1798  Xanthine/uracil/vitamin C permease  28.31 
 
 		 580 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426029 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  26.73 
 
 		 452 aa  123  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  28.62 
 
 		 647 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  26.55 
 
 		 451 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  26.9 
 
 		 462 aa  108  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  26.84 
 
 		 472 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  26.84 
 
 		 461 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1511  uracil-xanthine permease  26.38 
 
 		 413 aa  106  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0982636  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4214  uracil-xanthine permease  26.52 
 
 		 462 aa  105  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4497  uracil-xanthine permease  26.68 
 
 		 462 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  26.42 
 
 		 463 aa  104  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  26.62 
 
 		 461 aa  104  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  25 
 
 		 452 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  25.83 
 
 		 452 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  27 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  26.08 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  26.9 
 
 		 463 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  26.9 
 
 		 463 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  26.9 
 
 		 463 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  26.9 
 
 		 463 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  26.9 
 
 		 463 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  24.42 
 
 		 500 aa  101  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  26.81 
 
 		 466 aa  99.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  27.63 
 
 		 825 aa  99  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  28.16 
 
 		 463 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  26.18 
 
 		 466 aa  98.2  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  27.77 
 
 		 466 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0445  putative transporter  25.22 
 
 		 461 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  27.77 
 
 		 466 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  27.31 
 
 		 461 aa  97.1  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03512  predicted transporter  26.94 
 
 		 463 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.508451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0051  uracil-xanthine permease  26.94 
 
 		 463 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4158  xanthine permease  26.94 
 
 		 463 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03464  hypothetical protein  26.94 
 
 		 463 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  27.33 
 
 		 475 aa  96.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5027  xanthine permease  26.94 
 
 		 463 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  27.33 
 
 		 475 aa  96.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0057  uracil-xanthine permease  26.94 
 
 		 463 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0676705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3865  xanthine permease  26.94 
 
 		 463 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4105  xanthine permease  27.37 
 
 		 463 aa  95.5  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04610  putative transporter  25.22 
 
 		 461 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  27.96 
 
 		 465 aa  94.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2644  Xanthine/uracil/vitamin C permease  27.84 
 
 		 571 aa  94.7  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  28.22 
 
 		 465 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  25.88 
 
 		 450 aa  94.4  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3989  xanthine permease  27.37 
 
 		 463 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  26 
 
 		 459 aa  94.4  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000668836  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  27.19 
 
 		 465 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4150  uracil-xanthine permease  25.97 
 
 		 462 aa  93.6  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2148  xanthine/uracil permease family protein  26.37 
 
 		 445 aa  93.2  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  26.82 
 
 		 465 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0206  uracil-xanthine permease  27.08 
 
 		 413 aa  93.2  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0895  uracil-xanthine permease  26.85 
 
 		 413 aa  92.8  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  26.44 
 
 		 468 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  27.37 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3597  xanthine permease  24.73 
 
 		 459 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243938 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  27.31 
 
 		 665 aa  91.3  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3396  xanthine permease  25 
 
 		 459 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.559771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3992  xanthine/uracil permease family protein  24.3 
 
 		 459 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1841  uracil-xanthine permease  24.3 
 
 		 459 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  26.13 
 
 		 449 aa  90.1  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  27.78 
 
 		 459 aa  89.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29700  Xanthine/uracil permease family  28.67 
 
 		 434 aa  89.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  26.67 
 
 		 482 aa  87.8  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  27.06 
 
 		 478 aa  88.2  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  26.62 
 
 		 479 aa  88.2  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  26.83 
 
 		 469 aa  88.2  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1705  uracil-xanthine permease  26.56 
 
 		 413 aa  88.2  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.297144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3202  uracil permease  25.76 
 
 		 474 aa  87.8  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324856  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  26.19 
 
 		 458 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  24.22 
 
 		 488 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  26.13 
 
 		 505 aa  87  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  26.77 
 
 		 525 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  26.84 
 
 		 466 aa  86.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  29.06 
 
 		 640 aa  86.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  27.13 
 
 		 469 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  26.94 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  26.77 
 
 		 525 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  23.81 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  26.77 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  26.77 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  27.51 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  26.77 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  26.77 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  26.77 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  26.77 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  23.79 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  23.79 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  23.79 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  23.79 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  26.59 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  26.1 
 
 		 633 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>