28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3124 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3124  ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 
150 aa  300  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0877  hypothetical protein  32.62 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  35.29 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  33.61 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4033  hypothetical protein  29.92 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  28.46 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  32.47 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4133  hypothetical protein  32.82 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  28.04 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  30.23 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  37.97 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4596  hypothetical protein  30.08 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4684  hypothetical protein  30.08 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0831777  normal  0.858819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4979  hypothetical protein  30.08 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  29.55 
 
 
143 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  31.4 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  31.11 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1713  Ion transport protein  21.77 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0380308  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1278  hypothetical protein  27.68 
 
 
171 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  29.13 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  32.1 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2914  Ion transport 2 domain-containing protein  23.53 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  36.96 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  27.12 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  30.56 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1737  hypothetical protein  21.77 
 
 
157 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372846  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  31.87 
 
 
141 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44180  voltage-dependent potassium channel  23.4 
 
 
149 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0536818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>