More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2656 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2656  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  200  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0269  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  200  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0654574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  78.26 
 
 		 284 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  78.26 
 
 		 260 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  82.61 
 
 		 269 aa  102  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  81.16 
 
 		 269 aa  98.2  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  81.16 
 
 		 269 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  81.16 
 
 		 269 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2509  integrase  81.16 
 
 		 231 aa  98.2  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0263754 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0806  hypothetical protein  66.67 
 
 		 267 aa  97.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0787  hypothetical protein  66.67 
 
 		 206 aa  97.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3393  integrase catalytic subunit  65.22 
 
 		 274 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  59.42 
 
 		 312 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  59.42 
 
 		 307 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  59.42 
 
 		 309 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  59.42 
 
 		 290 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  62.32 
 
 		 309 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  59.42 
 
 		 290 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  62.32 
 
 		 309 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  62.32 
 
 		 309 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  59.42 
 
 		 290 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  59.42 
 
 		 290 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  55.07 
 
 		 290 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  55.88 
 
 		 372 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  55.88 
 
 		 372 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  55.88 
 
 		 372 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  55.88 
 
 		 372 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  55.88 
 
 		 372 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  55.88 
 
 		 372 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  55.88 
 
 		 372 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  55.88 
 
 		 372 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  55.88 
 
 		 372 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  55.88 
 
 		 372 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2624  integrase protein  54.41 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.947279  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3223  integrase protein  54.41 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3526  integrase protein  54.41 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3728  integrase protein  54.41 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  49.28 
 
 		 375 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  49.28 
 
 		 309 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  49.28 
 
 		 309 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  49.28 
 
 		 309 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  50.72 
 
 		 306 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  55.88 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  55.88 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  55.88 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  55.88 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  55.88 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  44.93 
 
 		 309 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  46.38 
 
 		 309 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  43.48 
 
 		 309 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  43.48 
 
 		 309 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  43.48 
 
 		 309 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  53.62 
 
 		 393 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  49.28 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  49.28 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5483  putative integrase  53.62 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.704423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  44.93 
 
 		 279 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  40.58 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3126  integrase catalytic subunit  45.07 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3247  integrase catalytic subunit  45.07 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00558432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3535  integrase catalytic subunit  45.07 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323423  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2970  integrase catalytic subunit  45.07 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0996434 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  46.38 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  44.29 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7700  IS3 family transposase  46.38 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0138  integrase catalytic subunit  46.48 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1484  integrase catalytic subunit  46.48 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2821  integrase catalytic subunit  46.48 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1301  integrase catalytic subunit  45.07 
 
 		 276 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1494  hypothetical protein  46.48 
 
 		 230 aa  63.9  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0828  ISRSO14-transposase orfB protein  42.86 
 
 		 275 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1492  ISRSO14-transposase orfB protein  42.86 
 
 		 275 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0134955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2405  ISRSO14-transposase orfB protein  42.86 
 
 		 275 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1217  ISRSO14-transposase orfB protein  42.86 
 
 		 275 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.163604 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  42.03 
 
 		 269 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2968  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2425  integrase catalytic subunit  42.03 
 
 		 276 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.043442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7753  putative transposase  46.48 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.0854702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2560  putative insertion element protein  46.38 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0008  putative insertion element protein  46.38 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0376  integrase catalytic region  44.93 
 
 		 274 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000146675  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  44.29 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4005  Integrase catalytic region  43.48 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795108  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0024  integrase core domain protein  45.71 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.73785  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  44.12 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  38.24 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  38.24 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  44.12 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  44.12 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  44.12 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000868543  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  44.12 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1432  Integrase catalytic region  41.18 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0301  IS1404 transposase  40 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0406  IS407A, transposase OrfB  40 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0471  IS407A, transposase OrfB  40 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>