28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5284 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5284  protein of unknown function DUF583  100 
 
 		 171 aa  341  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0430  hypothetical protein  65.05 
 
 		 183 aa  214  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0290  hypothetical protein  63.64 
 
 		 185 aa  207  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3896  hypothetical protein  59.34 
 
 		 184 aa  197  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0579  protein of unknown function DUF583  67.28 
 
 		 184 aa  195  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1347  hypothetical protein  64.67 
 
 		 221 aa  194  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0600  hypothetical protein  66.05 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.296784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4081  hypothetical protein  62.94 
 
 		 186 aa  191  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1225  protein of unknown function DUF583  56.38 
 
 		 189 aa  154  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0798  hypothetical protein  47.9 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  0.0126197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1801  hypothetical protein  66.34 
 
 		 185 aa  148  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2700  hypothetical protein  51.8 
 
 		 224 aa  141  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  51.55 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  49.07 
 
 		 247 aa  96.3  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1308  protein of unknown function DUF583  40.16 
 
 		 162 aa  85.1  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.677275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2023  hypothetical protein  45 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  30.63 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  31.53 
 
 		 119 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  31.11 
 
 		 131 aa  53.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  31.53 
 
 		 119 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1928  hypothetical protein  27.18 
 
 		 220 aa  51.6  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.284182 
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  33.64 
 
 		 195 aa  48.1  0.00006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  32.5 
 
 		 109 aa  45.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  25.49 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  26.17 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  35.29 
 
 		 115 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  31.25 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  29.82 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>