49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4587 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4587  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0954  hypothetical protein  46.33 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.636597  unclonable  0.0000321673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0284  hypothetical protein  42.6 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4617  hypothetical protein  42.61 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179085 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4266  hypothetical protein  42.92 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1008  hypothetical protein  43.06 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0999  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6677  hypothetical protein  27.73 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000431405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003240  chemotaxis protein MotB-related protein  26.64 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3786  chemotaxis protein MotB-related protein  24.1 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3412  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like protein  28.48 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2072  putative chemotaxis protein MotB  30.82 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.291136  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0111  putative chemotaxis protein MotB  29.79 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.876361  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1361  hypothetical protein  25.7 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0702  chemotaxis protein MotB, putative  28.57 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.66676  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0627  chemotaxis protein MotB, putative  28.57 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3877  OmpA/MotB domain protein  23.85 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0911  chemotaxis protein MotB, putative  28.28 
 
 		 316 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0745423  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1070  chemotaxis protein MotB, putative  28.67 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.98925  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0517  chemotaxis protein MotB, putative  27.96 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0452  hypothetical protein  25.77 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1217  OmpA/MotB domain protein  26.99 
 
 		 385 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000964512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5802  hypothetical protein  23.68 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0396159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4823  hypothetical protein  23.68 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  28.65 
 
 		 457 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3889  hypothetical protein  23.68 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  27.03 
 
 		 294 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0248  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 		 367 aa  46.2  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0007  hypothetical protein  20.83 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231859  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.66 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0873  OmpA/MotB domain protein  29.91 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1987 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  27.74 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1218  putative chemotaxis protein MotB  28.87 
 
 		 337 aa  44.3  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  26.35 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  27.4 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  24.62 
 
 		 510 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  28.91 
 
 		 360 aa  43.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  26.06 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  26.06 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  26.06 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  26.06 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  26.06 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  26.06 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  26.06 
 
 		 316 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2266  hypothetical protein  26.42 
 
 		 212 aa  42.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  26.62 
 
 		 217 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0232  hypothetical protein  21.11 
 
 		 230 aa  42  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0231  hypothetical protein  21.11 
 
 		 230 aa  42  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.317475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>