32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4548 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4548  HNH endonuclease  100 
 
 		 192 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1436  HNH nuclease  33.09 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2827  HNH nuclease  35.53 
 
 		 292 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2755  HNH nuclease  35.53 
 
 		 292 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2057  HNH nuclease  35.53 
 
 		 295 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270784  normal  0.012989 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1316  HNH nuclease  35.53 
 
 		 292 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.828783  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  36.05 
 
 		 427 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2805  hypothetical protein  36.84 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.4769199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  45.16 
 
 		 459 aa  48.9  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  45.16 
 
 		 459 aa  47.8  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  40.96 
 
 		 133 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  46.03 
 
 		 146 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  31.68 
 
 		 1138 aa  46.2  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 427 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  31.88 
 
 		 634 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  32 
 
 		 461 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2438  group II intron, maturase-specific  30.43 
 
 		 338 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  39.22 
 
 		 459 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  29.58 
 
 		 635 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  37.25 
 
 		 471 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1119  group II intron, maturase-specific  30.43 
 
 		 338 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  29.58 
 
 		 635 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  46 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02160  hypothetical protein  32.65 
 
 		 370 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  46 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2450  HNH endonuclease  31.76 
 
 		 143 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.156299 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 438 aa  42.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  42.11 
 
 		 454 aa  42.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 443 aa  42  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  41.27 
 
 		 174 aa  41.6  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  32.69 
 
 		 435 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  25.53 
 
 		 236 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>