26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3242 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3242  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  350  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1808  hypothetical protein  53.61 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0352824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4855  hypothetical protein  50.6 
 
 		 189 aa  150  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457667  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6270  hypothetical protein  47.09 
 
 		 171 aa  140  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.481188  normal  0.278724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1774  hypothetical protein  47.24 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1123  hypothetical protein  48.72 
 
 		 178 aa  124  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1088  hypothetical protein  42.58 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1233  hypothetical protein  48.72 
 
 		 178 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6286  hypothetical protein  48.08 
 
 		 168 aa  121  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0369  hypothetical protein  43.75 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0012  hypothetical protein  41.38 
 
 		 159 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2040  hypothetical protein  42.48 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3018  hypothetical protein  30 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.755001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0708  hypothetical protein  37.89 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2934  hypothetical protein  30.3 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5311  hypothetical protein  32.69 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0143  hypothetical protein  37.97 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3297  hypothetical protein  38.6 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0938  hypothetical protein  32.47 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2935  hypothetical protein  40.19 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2690  hypothetical protein  31.97 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1061  hypothetical protein  34.07 
 
 		 464 aa  54.7  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318763  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0266  hypothetical protein  32.62 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.431881  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4887  hypothetical protein  30 
 
 		 152 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4939  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1599  hypothetical protein  27.91 
 
 		 139 aa  41.6  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.258269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>