55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05034 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05034  DnaK suppressor protein  100 
 
 		 72 aa  149  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1036  probable rRNA transcription initiatior protein,putative phage gene  49.28 
 
 		 71 aa  67.4  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1048  hypothetical protein  49.25 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0756  hypothetical protein  44.44 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0374591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1685  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.67 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.554769  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07970  hypothetical protein  42.03 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  2.71217e-16  hitchhiker  0.000634076 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2881  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000120273  normal  0.0538694 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0801  phage/conjugal plasmid C-4 type zinc finger protein  41.67 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.500339  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3778  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.563726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0124  hypothetical protein  54.55 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1494  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.28 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0827  hypothetical protein  45.28 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2840  hypothetical protein  47.17 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0871  hypothetical protein  47.17 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2085  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.1 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00787  hypothetical protein  47.17 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0858  hypothetical protein  47.17 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00770  hypothetical protein  47.17 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2397  hypothetical protein  48.94 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2839  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.17 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2549  hypothetical protein  47.17 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0875  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0418872  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0952  hypothetical protein  47.17 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01805  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1690  hypothetical protein  45.45 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2675  hypothetical protein  52.78 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00494  hypothetical protein  39.71 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3419  C4-type zinc finger protein, DksA/TraR family  41.18 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00386497  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00488  conserved hypothetical protein  39.71 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1862  hypothetical protein  40.35 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00332482  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2541  hypothetical protein  45.45 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1677  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3162  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.28 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0478  phage TraR/DksA family protein  43.48 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.1711  normal  0.241622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1292  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2758  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0133  hypothetical protein  52.27 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0695  hypothetical protein  43.06 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3037  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  37.68 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0965532  normal  0.257312 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1463  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.690044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1480  hypothetical protein  48.89 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5061  hypothetical protein  43.06 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0899139  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0832  hypothetical protein  36.54 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162884 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0030  conjugal transfer protein TraR  36.11 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2519  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227873  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1292  hypothetical protein  45.83 
 
 		 88 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0645642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2983  hypothetical protein  39.29 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000187823  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0920  hypothetical protein  58.06 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0973  hypothetical protein  58.06 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0730  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00565405  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0952  hypothetical protein  58.06 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0889  hypothetical protein  58.06 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4228  hypothetical protein  54.84 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312261 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2120  hypothetical protein  48.84 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.40904  normal  0.833846 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1833  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.51 
 
 		 74 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>