147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02892 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  84.62 
 
 		 383 aa  673    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  791    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  56.53 
 
 		 389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  31.84 
 
 		 638 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  32.37 
 
 		 422 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  32.37 
 
 		 424 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  32.08 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  44.62 
 
 		 373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  30.23 
 
 		 356 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  41.15 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  41.15 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  41.15 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  41.15 
 
 		 357 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  40.62 
 
 		 357 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  40.62 
 
 		 357 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  40.62 
 
 		 357 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  39.29 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  40.62 
 
 		 357 aa  152  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  41.15 
 
 		 364 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  40.62 
 
 		 357 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  29.76 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  40.1 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  40.1 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  40.1 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  40.1 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  29.89 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  29.55 
 
 		 372 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  29.76 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  30.06 
 
 		 335 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  29.18 
 
 		 380 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  30.06 
 
 		 335 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  30.48 
 
 		 378 aa  146  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  36.32 
 
 		 415 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  40.86 
 
 		 345 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  37.38 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  35.9 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  35.5 
 
 		 305 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  33 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  37.89 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  36.22 
 
 		 290 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  36.22 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  30.89 
 
 		 285 aa  95.1  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  25.5 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  32.43 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  29.08 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  28.27 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  28.27 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  29.02 
 
 		 290 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  30.86 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  27.6 
 
 		 284 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  28.42 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  29.02 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  29.02 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  30.06 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  26.98 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  26.7 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  28.27 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  27.89 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  28.27 
 
 		 283 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  28.27 
 
 		 283 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  28.27 
 
 		 283 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  26.56 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  24.75 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  26.56 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  26.56 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  26.56 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  26.56 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  26.56 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  23.89 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  26.56 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  24.12 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  26.04 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  28.42 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  26.94 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  26.84 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  25.98 
 
 		 293 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  27.37 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  28.21 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  28.86 
 
 		 289 aa  67  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  27.69 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  28.21 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  26.48 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  26.67 
 
 		 282 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  26.84 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  28.02 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  27.08 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  22.87 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  28.34 
 
 		 290 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  23.12 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  27.69 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  22.9 
 
 		 306 aa  57  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  28.5 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  25 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  25.56 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  28.5 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2927  patatin  23.5 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.224599  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  26.21 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  28.65 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  26.69 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  29.69 
 
 		 470 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>