More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02106 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02106  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  673    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1626  periplasmic binding protein  60.06 
 
 		 322 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2591  ferric siderophore ABC transporter, periplasmic siderophore-binding protein  63.03 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619611  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3467  periplasmic binding protein  55.49 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3340  periplasmic binding protein  55.8 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.002385  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3666  periplasmic binding protein  55.31 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  30.16 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2404  periplasmic binding protein  35 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0899785  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0021  periplasmic binding protein  33.23 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  31.53 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1928  periplasmic binding protein  33.09 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0734  periplasmic binding protein  31.32 
 
 		 348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1111  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  32.28 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0632  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  31.23 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34400  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  31.58 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  30.79 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1354  enterochelin ABC transporter, periplasmic enterochelin-binding protein, authentic frameshift  29.84 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0661  periplasmic binding protein  31 
 
 		 354 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3787  periplasmic binding protein  33.66 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  32.99 
 
 		 316 aa  162  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000332  ferric vibriobactin enterobactin transport system substrate-binding protein VctP  30.47 
 
 		 302 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000938047  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3797  periplasmic binding protein  31.23 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0675  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  30.88 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  32.98 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  32.98 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  32.98 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06135  ABC-type enterochelin transport system periplasmic protein  29.5 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1005  periplasmic binding protein  29.93 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  29.14 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000270207  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1025  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.27 
 
 		 348 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0273694  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1393  periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0393092  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1907  periplasmic binding protein  32.06 
 
 		 350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.217732  normal  0.206334 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4396  periplasmic binding protein  28.34 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4264  transport system permease protein  31.79 
 
 		 293 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0403  transferrin receptor  30.18 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.400692  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2366  periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.10704 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0300  periplasmic binding protein  29.69 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2627  periplasmic binding protein  29.79 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3079  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.29 
 
 		 312 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0760  periplasmic binding protein  28.1 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0777  periplasmic binding protein  28.1 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3806  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.17678 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1007  iron-compound ABC transporter, iron-compound-binding protein  27.47 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00224248  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25350  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  29.93 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5226  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.28 
 
 		 337 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  30.39 
 
 		 662 aa  99.4  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4795  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.67 
 
 		 337 aa  99  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000034871  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0949  transferrin receptor  26.37 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0298481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5247  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.98 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4815  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.67 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000198288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5197  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.67 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5234  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.1 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4953  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.98 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00660828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5330  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.98 
 
 		 333 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00008609  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3702  periplasmic binding protein  30.57 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  29.72 
 
 		 319 aa  92.8  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2916  periplasmic binding protein  25.23 
 
 		 337 aa  92.8  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.421383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4918  periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000189068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2663  periplasmic binding protein  24.85 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.87 
 
 		 322 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  25.45 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.56 
 
 		 322 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0634  periplasmic binding protein  25.34 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000010772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0007  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.23 
 
 		 339 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.85 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04580  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  26.79 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.398248  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.85 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  25.63 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  25.22 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.44 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  25.87 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  24.83 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.83 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30540  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  25.25 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.48 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  24.48 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.14 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  27.91 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  23.79 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2663  periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  23.43 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  26.91 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  28.26 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  27.4 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  27.91 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  24.2 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  25.51 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  23.7 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  24.13 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  32.05 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  24.1 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2424  periplasmic binding protein  30 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16600  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  26.25 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3293  periplasmic binding protein  24.23 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  23.25 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  23.25 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  23.25 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>