81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01917 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003163  putative ATP-binding protein  88.65 
 
 
458 aa  849    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0924  hypothetical protein  69 
 
 
457 aa  664    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01917  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  956    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0484  hypothetical protein  60.56 
 
 
465 aa  579  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2154  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  54.72 
 
 
467 aa  544  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.487919  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1647  hypothetical protein  54.29 
 
 
465 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246236 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1465  YcjX  54.29 
 
 
465 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1810  YcjX  54.29 
 
 
465 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.369359 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1871  hypothetical protein  54.51 
 
 
465 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0200876 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1809  hypothetical protein  54.08 
 
 
465 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000109841 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1554  hypothetical protein  54.08 
 
 
465 aa  535  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2304  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  54.29 
 
 
465 aa  537  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000476158  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1898  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  53.86 
 
 
465 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.275408  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01298  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  54.29 
 
 
465 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00160773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1966  hypothetical protein  54.29 
 
 
465 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.575033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1790  hypothetical protein  53.86 
 
 
465 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01309  hypothetical protein  54.29 
 
 
465 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00070724  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1436  hypothetical protein  54.29 
 
 
465 aa  537  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2325  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  54.08 
 
 
465 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000152241  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2607  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  54.41 
 
 
465 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0283898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1801  hypothetical protein  53.86 
 
 
465 aa  533  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2533  hypothetical protein  53.86 
 
 
465 aa  534  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2619  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  53.65 
 
 
465 aa  534  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.509235 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1532  hypothetical protein  53.86 
 
 
465 aa  533  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2327  hypothetical protein  53.98 
 
 
465 aa  531  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1725  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  53.76 
 
 
469 aa  522  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.61398  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1757  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  51.61 
 
 
471 aa  508  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0595  ATPase  47.64 
 
 
469 aa  436  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1231  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  47.96 
 
 
463 aa  431  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3001  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  45.91 
 
 
474 aa  428  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3769  hypothetical protein  42.56 
 
 
491 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2666  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  44.3 
 
 
481 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.543288  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1810  ATPase  44.77 
 
 
485 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2547  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  44.47 
 
 
486 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2645  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  44.47 
 
 
486 aa  411  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.334316  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1240  ATPase  45.18 
 
 
473 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0367187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2479  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  44.47 
 
 
486 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1643  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  45.64 
 
 
486 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1505  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  45.44 
 
 
490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1557  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  44.82 
 
 
484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149306 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1609  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  45.87 
 
 
486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2734  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  45.23 
 
 
486 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.441431  normal  0.169047 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1620  hypothetical protein  45.25 
 
 
486 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2477  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  44.94 
 
 
482 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2493  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  44.19 
 
 
481 aa  398  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0451147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3097  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  43.22 
 
 
484 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25777  hitchhiker  0.000036158 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2575  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  43.1 
 
 
480 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0355186  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2470  hypothetical protein  39.01 
 
 
489 aa  322  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1417  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  40.21 
 
 
487 aa  318  9e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6674  hypothetical protein  38.12 
 
 
487 aa  315  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1966  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  39.7 
 
 
491 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2178  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  39.19 
 
 
491 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424352  decreased coverage  0.00243917 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0639  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  39.96 
 
 
455 aa  311  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0251795  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1772  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  36.29 
 
 
489 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3019  YcjX-like protein  37.16 
 
 
502 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2410  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  36.81 
 
 
493 aa  308  9e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1529  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  39.2 
 
 
499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2120  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  38.59 
 
 
486 aa  306  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979015  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3389  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  37.37 
 
 
489 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0183343  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3702  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  35.95 
 
 
489 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.79297 
 
 
-
 
NC_004310  BR1034  hypothetical protein  38.09 
 
 
486 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.565979  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3941  hypothetical protein  35.74 
 
 
489 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00618827  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1000  hypothetical protein  38.51 
 
 
486 aa  301  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4270  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  35.83 
 
 
488 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3519  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  37.5 
 
 
500 aa  299  6e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000525714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1420  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  35.45 
 
 
481 aa  298  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3463  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  37.87 
 
 
470 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0553743  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0501  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  36.61 
 
 
471 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.668123  normal  0.149534 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0570  hypothetical protein  36.82 
 
 
476 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67906  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2223  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  36.82 
 
 
476 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0930099  normal  0.347375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4117  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  39.19 
 
 
484 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.038958  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1937  YcjX-like family protein  38.63 
 
 
470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113085 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2385  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  36.73 
 
 
465 aa  277  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2137  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  34.49 
 
 
502 aa  257  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.361768 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1783  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  34.92 
 
 
482 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2119  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  35.06 
 
 
482 aa  249  8e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7088  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  36.01 
 
 
481 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1725  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  34.49 
 
 
482 aa  246  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862269  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6216  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  36.01 
 
 
481 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.940884 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1175  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  31.07 
 
 
443 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00138  hypothetical protein  27.95 
 
 
479 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>