76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003792 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003792  heat shock protein HslJ  100 
 
 
148 aa  303  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000159287  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02669  hypothetical protein  89.19 
 
 
147 aa  271  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1268  heat shock protein HslJ  74.15 
 
 
147 aa  227  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000183655  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2085  heat shock protein  67.35 
 
 
147 aa  207  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1917  heat-inducible protein  33.12 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2211  heat-inducible protein  33.12 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.27688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1807  heat-inducible protein  33.12 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1765  heat-inducible protein  28.97 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0625871 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2601  heat-inducible protein  32.89 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1691  heat-inducible protein  28.97 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  hitchhiker  0.00277177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1768  heat-inducible protein  28.28 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0151813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1828  heat-inducible protein  28.97 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1616  heat-inducible protein  31.03 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1773  heat-inducible protein  31.03 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2276  heat-inducible protein  31.03 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1466  heat-inducible protein  31.03 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01363  hypothetical protein  31.03 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2266  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.03 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221661  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01351  heat-inducible protein  31.03 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1508  heat-inducible protein  27.59 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1563  heat-inducible protein  31.03 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2000  heat-inducible protein  31.03 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0202  heat shock protein HslJ  33.33 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  30.82 
 
 
281 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2134  heat-inducible protein  23.94 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.567559  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3124  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.69 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000058993  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.33 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0867  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.89 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0776  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.11 
 
 
137 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  29.32 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3589  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.81 
 
 
287 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0923  hypothetical protein  35.62 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.52 
 
 
183 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.1 
 
 
351 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  26.96 
 
 
157 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3548  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.85 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3479  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.85 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0769  hypothetical protein  34.85 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3302  hypothetical protein  27.27 
 
 
179 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3670  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.85 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.141959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3258  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.71 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0864  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.85 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.847217  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0765  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.71 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1375  transcriptional regulator, LysR family  22.76 
 
 
458 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3361  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.71 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  29.55 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  42 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4760  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.03 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1028  putative lipoprotein  27.52 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0974  putative lipoprotein  27.88 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1173  putative lipoprotein  27.88 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.891914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.42 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  27.34 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.53 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2767  hypothetical protein  41.67 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.36 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  35.19 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  28.74 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.52 
 
 
282 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3658  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.16 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.76 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  26.27 
 
 
246 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.38 
 
 
221 aa  41.6  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2272  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.16 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.88 
 
 
305 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  23.4 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0543  conserved hypothetical META domain lipoprotein  25.44 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.12 
 
 
273 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.58 
 
 
274 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.58 
 
 
280 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  23.4 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  30 
 
 
478 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.57 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  24.29 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30 
 
 
478 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.94 
 
 
206 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>